PSMA1

PSMA1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4R3O, 4R67, 1IRU, 5A0Q
Ідентифікатори
Символи	PSMA1, HC2, HEL-S-275, NU, PROS30, Proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha 1, proteasome subunit alpha 1, proteasome 20S subunit alpha 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602854 MGI: 1347005 HomoloGene: 2080 GeneCards: PSMA1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• endopeptidase activity; • GO:0070122 peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • threonine-type endopeptidase activity; • hydrolase activity; • lipopolysaccharide binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Полісома; • гіалоплазма; • центросома; • нуклеоплазма; • Протеасома; • екзосома; • клітинне ядро; • proteasome core complex; • proteasome core complex, alpha-subunit complex;
Біологічний процес	• regulation of cellular amino acid metabolic process; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • regulation of mRNA stability; • процес імунної системи; • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway; • protein polyubiquitination; • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • протеоліз; • MAPK cascade; • Fc-epsilon receptor signaling pathway; • NIK/NF-kappaB signaling; • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process; • proteolysis involved in cellular protein catabolic process; • T cell receptor signaling pathway; • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway; • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; • protein deubiquitination; • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • трансмембранний транспорт; • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; • посттрансляційна модифікація; • regulation of hematopoietic stem cell differentiation; • negative regulation of inflammatory response to antigenic stimulus; • proteasomal protein catabolic process; • proteasomal ubiquitin-independent protein catabolic process; • interleukin-1-mediated signaling pathway; • regulation of mitotic cell cycle phase transition;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5682
	26440
	ENSG00000129084
	ENSMUSG00000030751
	P25786
	Q9R1P4
	NM_148976; NM_001143937; NM_002786
	NM_011965
	NP_001137409; NP_002777; NP_683877
	NP_036095
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PSMA1 (англ. Proteasome subunit alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 263 амінокислот, а молекулярна маса — 29 556^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFRNQYDNDV	TVWSPQGRIH	QIEYAMEAVK	QGSATVGLKS	KTHAVLVALK
RAQSELAAHQ	KKILHVDNHI	GISIAGLTAD	ARLLCNFMRQ	ECLDSRFVFD
RPLPVSRLVS	LIGSKTQIPT	QRYGRRPYGV	GLLIAGYDDM	GPHIFQTCPS
ANYFDCRAMS	IGARSQSART	YLERHMSEFM	ECNLNELVKH	GLRALRETLP
AEQDLTTKNV	SIGIVGKDLE	FTIYDDDDVS	PFLEGLEERP	QRKAQPAQPA
DEPAEKADEP	MEH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, треонінових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Silva-Pereira I., Bey F., Coux O., Scherrer K. (1992). Two mRNAs exist for the Hs PROS-30 gene encoding a component of human prosomes. Gene. 120: 235—242. PMID 1398136 DOI:10.1016/0378-1119(92)90098-A
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Kristensen P., Johnsen A.H., Uerkvitz W., Tanaka K., Hendil K.B. (1994). Human proteasome subunits from 2-dimensional gels identified by partial sequencing. Biochem. Biophys. Res. Commun. 205: 1785—1789. PMID 7811265 DOI:10.1006/bbrc.1994.2876
Yano M., Koumoto Y., Kanesaki Y., Wu X., Kido H. (2004). 20S proteasome prevents aggregation of heat-denatured proteins without PA700 regulatory subcomplex like a molecular chaperone. Biomacromolecules. 5: 1465—1469. PMID 15244466 DOI:10.1021/bm049957a
Zhang Y., Jia L., Lee S.J., Wang M.M. (2007). Conserved signal peptide of Notch3 inhibits interaction with proteasome. Biochem. Biophys. Res. Commun. 355: 245—251. PMID 17292860 DOI:10.1016/j.bbrc.2007.01.151
Rut W., Drag M. (2016). Human 20S proteasome activity towards fluorogenic peptides of various chain lengths. Biol. Chem. 397: 921—926. PMID 27176742 DOI:10.1515/hsz-2016-0176