PSMC3IP

PSMC3IP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MH2
Ідентифікатори
Символи	PSMC3IP, GT198, HOP2, HUMGT198A, ODG3, TBPIP, PSMC3 interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 608665 MGI: 1098610 HomoloGene: 5940 GeneCards: PSMC3IP
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nuclear receptor coactivator activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • компонент клітини Біологічний процес • DNA recombination • GO:0007126 мейоз • reciprocal meiotic recombination • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29893	19183
Ensembl	ENSG00000131470	ENSMUSG00000019303
UniProt	Q9P2W1	O35047
RefSeq (мРНК)	NM_001256014 NM_001256015 NM_001256016 NM_013290 NM_016556	NM_008949
RefSeq (білок)	NP_001242943 NP_001242944 NP_001242945 NP_037422 NP_057640	NP_032975
Локус (UCSC)	Хр. 17: 42.57 – 42.58 Mb	Хр. 11: 100.98 – 100.99 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PSMC3IP (англ. PSMC3 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 217 амінокислот, а молекулярна маса — 24 906.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKGRAEAAA		GAAGILLRYL		QEQNRPYSSQ		DVFGNLQREH		GLGKAVVVKT
LEQLAQQGKI		KEKMYGKQKI		YFADQDQFDM		VSDADLQVLD		GKIVALTAKV
QSLQQSCRYM		EAELKELSSA		LTTPEMQKEI		QELKKECAGY		RERLKNIKAA
TNHVTPEEKE		QVYRERQKYC		KEWRKRKRMA		TELSDAILEG		YPKSKKQFFE
EVGIETDEDY		NVTLPDP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як рекомбінація ДНК, мейоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Ko L., Cardona G.R., Henrion-Caude A., Chin W.W. (2002). Identification and characterization of a tissue-specific coactivator, GT198, that interacts with the DNA-binding domains of nuclear receptors. Mol. Cell. Biol. 22: 357—369. PMID 11739747 DOI:10.1128/MCB.22.1.357-369.2002
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Pan Q., Luo X., Chegini N. (2007). Genomic and proteomic profiling I: leiomyomas in African Americans and Caucasians. Reprod. Biol. Endocrinol. 5: 34—34. PMID 17716379 DOI:10.1186/1477-7827-5-34

Див. також

• Хромосома 17