PTPRS

PTPRS
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2FH7, 2YD2, 2YD3, 2YD9, 4BPC, 4PBX
Ідентифікатори
Символи	PTPRS, PTPSIGMA, protein tyrosine phosphatase, receptor type S, R-PTP-S, R-PTP-sigma, protein tyrosine phosphatase receptor type S
Зовнішні ІД	OMIM: 601576 MGI: 97815 HomoloGene: 20626 GeneCards: PTPRS
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • hydrolase activity; • phosphoprotein phosphatase activity; • protein tyrosine phosphatase activity; • heparin binding; • chondroitin sulfate binding; • heparan sulfate proteoglycan binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • integral component of plasma membrane; • екзосома; • мембрана; • клітинна мембрана; • integral component of synaptic vesicle membrane; • integral component of postsynaptic density membrane; • GO:0097483, GO:0097481 Постсинаптичне ущільнення; • Міжклітинні контакти; • аксон; • synaptic vesicle membrane; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • cell projection; • neuron projection; • перикаріон; • синапс; • postsynaptic membrane; • Schaffer collateral - CA1 synapse; • glutamatergic synapse; • integral component of presynaptic membrane;
Біологічний процес	• адгезія клітин; • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання; • GO:0016576 protein dephosphorylation; • negative regulation of interferon-alpha production; • negative regulation of interferon-beta production; • negative regulation of toll-like receptor 9 signaling pathway; • negative regulation of neuron projection development; • spinal cord development; • cerebellum development; • hippocampus development; • cerebral cortex development; • corpus callosum development; • negative regulation of axon extension; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation; • negative regulation of collateral sprouting; • negative regulation of axon regeneration; • negative regulation of dendritic spine development; • establishment of endothelial intestinal barrier; • modulation of chemical synaptic transmission; • synapse organization; • regulation of postsynaptic density assembly; • synaptic membrane adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5802
	19280
	ENSG00000105426
	ENSMUSG00000013236
	Q13332
	B0V2N1
NM_002850; NM_130853; NM_130854; NM_130855; NM_001394011;
	NM_001394012; NM_001394013
	NM_001252453; NM_001252455; NM_001252456; NM_011218
	NP_002841; NP_570923; NP_570924; NP_570925
	NP_001239382; NP_001239384; NP_001239385; NP_035348
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTPRS (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type S) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 948 амінокислот, а молекулярна маса — 217 041^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPTWGPGMV	SVVGPMGLLV	VLLVGGCAAE	EPPRFIKEPK	DQIGVSGGVA
SFVCQATGDP	KPRVTWNKKG	KKVNSQRFET	IEFDESAGAV	LRIQPLRTPR
DENVYECVAQ	NSVGEITVHA	KLTVLREDQL	PSGFPNIDMG	PQLKVVERTR
TATMLCAASG	NPDPEITWFK	DFLPVDPSAS	NGRIKQLRSE	TFESTPIRGA
LQIESSEETD	QGKYECVATN	SAGVRYSSPA	NLYVRELREV	RRVAPRFSIL
PMSHEIMPGG	NVNITCVAVG	SPMPYVKWMQ	GAEDLTPEDD	MPVGRNVLEL
TDVKDSANYT	CVAMSSLGVI	EAVAQITVKS	LPKAPGTPMV	TENTATSITI
TWDSGNPDPV	SYYVIEYKSK	SQDGPYQIKE	DITTTRYSIG	GLSPNSEYEI
WVSAVNSIGQ	GPPSESVVTR	TGEQAPASAP	RNVQARMLSA	TTMIVQWEEP
VEPNGLIRGY	RVYYTMEPEH	PVGNWQKHNV	DDSLLTTVGS	LLEDETYTVR
VLAFTSVGDG	PLSDPIQVKT	QQGVPGQPMN	LRAEARSETS	ITLSWSPPRQ
ESIIKYELLF	REGDHGREVG	RTFDPTTSYV	VEDLKPNTEY	AFRLAARSPQ
GLGAFTPVVR	QRTLQSKPSA	PPQDVKCVSV	RSTAILVSWR	PPPPETHNGA
LVGYSVRYRP	LGSEDPEPKE	VNGIPPTTTQ	ILLEALEKWT	QYRITTVAHT
EVGPGPESSP	VVVRTDEDVP	SAPPRKVEAE	ALNATAIRVL	WRSPAPGRQH
GQIRGYQVHY	VRMEGAEARG	PPRIKDVMLA	DAQWETDDTA	EYEMVITNLQ
PETAYSITVA	AYTMKGDGAR	SKPKVVVTKG	AVLGRPTLSV	QQTPEGSLLA
RWEPPAGTAE	DQVLGYRLQF	GREDSTPLAT	LEFPPSEDRY	TASGVHKGAT
YVFRLAARSR	GGLGEEAAEV	LSIPEDTPRG	HPQILEAAGN	ASAGTVLLRW
LPPVPAERNG	AIVKYTVAVR	EAGALGPARE	TELPAAAEPG	AENALTLQGL
KPDTAYDLQV	RAHTRRGPGP	FSPPVRYRTF	LRDQVSPKNF	KVKMIMKTSV
LLSWEFPDNY	NSPTPYKIQY	NGLTLDVDGR	TTKKLITHLK	PHTFYNFVLT
NRGSSLGGLQ	QTVTAWTAFN	LLNGKPSVAP	KPDADGFIMV	YLPDGQSPVP
VQSYFIVMVP	LRKSRGGQFL	TPLGSPEDMD	LEELIQDISR	LQRRSLRHSR
QLEVPRPYIA	ARFSVLPPTF	HPGDQKQYGG	FDNRGLEPGH	RYVLFVLAVL
QKSEPTFAAS	PFSDPFQLDN	PDPQPIVDGE	EGLIWVIGPV	LAVVFIICIV
IAILLYKNKP	DSKRKDSEPR	TKCLLNNADL	APHHPKDPVE	MRRINFQTPD
SGLRSPLREP	GFHFESMLSH	PPIPIADMAE	HTERLKANDS	LKLSQEYESI
DPGQQFTWEH	SNLEVNKPKN	RYANVIAYDH	SRVILQPIEG	IMGSDYINAN
YVDGYRCQNA	YIATQGPLPE	TFGDFWRMVW	EQRSATIVMM	TRLEEKSRIK
CDQYWPNRGT	ETYGFIQVTL	LDTIELATFC	VRTFSLHKNG	SSEKREVRQF
QFTAWPDHGV	PEYPTPFLAF	LRRVKTCNPP	DAGPIVVHCS	AGVGRTGCFI
VIDAMLERIK	PEKTVDVYGH	VTLMRSQRNY	MVQTEDQYSF	IHEALLEAVG
CGNTEVPARS	LYAYIQKLAQ	VEPGEHVTGM	ELEFKRLANS	KAHTSRFISA
NLPCNKFKNR	LVNIMPYEST	RVCLQPIRGV	EGSDYINASF	IDGYRQQKAY
IATQGPLAET	TEDFWRMLWE	NNSTIVVMLT	KLREMGREKC	HQYWPAERSA
RYQYFVVDPM	AEYNMPQYIL	REFKVTDARD	GQSRTVRQFQ	FTDWPEQGVP
KSGEGFIDFI	GQVHKTKEQF	GQDGPISVHC	SAGVGRTGVF	ITLSIVLERM
RYEGVVDIFQ	TVKMLRTQRP	AMVQTEDEYQ	FCYQAALEYL	GSFDHYAT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, рецепторів, протеїн-фосфатаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, синапсах, синаптосомах^[en].

Література[ред. | ред. код]

Pulido R., Serra-Pages C., Tang M., Streuli M. (1995). The LAR/PTP delta/PTP sigma subfamily of transmembrane protein-tyrosine-phosphatases: multiple human LAR, PTP delta, and PTP sigma isoforms are expressed in a tissue-specific manner and associate with the LAR-interacting protein LIP.1. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 11686—11690. PMID 8524829 DOI:10.1073/pnas.92.25.11686
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Serra-Pages C., Medley Q.G., Tang M., Hart A., Streuli M. (1998). Liprins, a family of LAR transmembrane protein-tyrosine phosphatase-interacting proteins. J. Biol. Chem. 273: 15611—15620. PMID 9624153 DOI:10.1074/jbc.273.25.15611
Jeon T.J., Chien P.N., Chun H.J., Ryu S.E. (2013). Structure of the catalytic domain of protein tyrosine phosphatase sigma in the sulfenic acid form. Mol. Cells. 36: 55—61. PMID 23820885 DOI:10.1007/s10059-013-0033-x