PYCARD

PYCARD
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1UCP, 2KN6, 3J63, 5H8O
Ідентифікатори
Символи	PYCARD, ASC, CARD5, TMS, TMS-1, TMS1, PYD and CARD domain containing
Зовнішні ІД	OMIM: 606838 MGI: 1931465 HomoloGene: 8307 GeneCards: PYCARD
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • interleukin-6 receptor binding; • BMP receptor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • identical protein binding; • enzyme binding; • cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • Pyrin domain binding; • cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process; • myosin I binding; • tropomyosin binding; • protease binding; • transmembrane transporter binding; • protein dimerization activity; • cysteine-type endopeptidase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • NLRP3 inflammasome complex; • NLRP1 inflammasome complex; • AIM2 inflammasome complex; • ядерце; • ендоплазматичний ретикулум; • мітохондрія; • IkappaB kinase complex; • клітинне ядро; • secretory granule lumen; • azurophil granule lumen; • extracellular region; • гіалоплазма; • GO:0009327 protein-containing complex; • neuronal cell body; • Golgi membrane; • комплекс Ґольджі; • мембрана;
Біологічний процес	• positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity; • regulation of apoptotic process; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator; • regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway; • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator; • positive regulation of adaptive immune response; • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium; • процес імунної системи; • cellular response to tumor necrosis factor; • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; • positive regulation of JNK cascade; • negative regulation of interferon-beta production; • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • myeloid dendritic cell activation; • positive regulation of T cell activation; • defense response to virus; • cellular response to interleukin-1; • positive regulation of apoptotic process; • positive regulation of tumor necrosis factor production; • positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria; • negative regulation of protein serine/threonine kinase activity; • positive regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway; • inflammatory response; • cellular response to lipopolysaccharide; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • GO:0097285 апоптоз; • вроджений імунітет; • neutrophil degranulation; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • activation of innate immune response; • myeloid dendritic cell activation involved in immune response; • positive regulation of antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class II; • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • positive regulation of actin filament polymerization; • regulation of protein stability; • positive regulation of interferon-gamma production; • positive regulation of interleukin-6 production; • positive regulation of activated T cell proliferation; • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • macropinocytosis; • positive regulation of phagocytosis; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of T cell migration; • positive regulation of defense response to virus by host; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; • response to bacterium; • regulation of autophagy; • interleukin-1 beta production; • GO:0043087, GO:0032313, GO:0032319, GO:0032314, GO:0043088 regulation of GTPase activity; • regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • regulation of inflammatory response; • protein homooligomerization; • activation of cysteine-type endopeptidase activity; • negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response; • протеоліз; • positive regulation of interleukin-1 beta production;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	29108
	66824
	ENSG00000103490
	ENSMUSG00000030793
	Q9ULZ3
	Q9EPB4
	NM_145183; NM_013258; NM_145182
	NM_023258
	NP_037390; NP_660183
	NP_075747
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PYCARD (англ. PYD and CARD domain containing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 195 амінокислот, а молекулярна маса — 21 627^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGRARDAILD	ALENLTAEEL	KKFKLKLLSV	PLREGYGRIP	RGALLSMDAL
DLTDKLVSFY	LETYGAELTA	NVLRDMGLQE	MAGQLQAATH	QGSGAAPAGI
QAPPQSAAKP	GLHFIDQHRA	ALIARVTNVE	WLLDALYGKV	LTDEQYQAVR
AEPTNPSKMR	KLFSFTPAWN	WTCKDLLLQA	LRESQSYLVE	DLERS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, імунітет, вроджений імунітет, запальна відповідь, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мітохондрії, ендоплазматичному ретикулумі.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Martinon F., Burns K., Tschopp J. (2002). The inflammasome: a molecular platform triggering activation of inflammatory caspases and processing of proIL-beta. Mol. Cell. 10: 417—426. PMID 12191486 DOI:10.1016/S1097-2765(02)00599-3
Dowds T.A., Masumoto J., Zhu L., Inohara N., Nunez G. (2004). Cryopyrin-induced interleukin 1beta secretion in monocytic cells: enhanced activity of disease-associated mutants and requirement for ASC. J. Biol. Chem. 279: 21924—21928. PMID 15020601 DOI:10.1074/jbc.M401178200
Bedoya F., Sandler L.L., Harton J.A. (2007). Pyrin-only protein 2 modulates NF-kappaB and disrupts ASC:CLR interactions. J. Immunol. 178: 3837—3845. PMID 17339483 DOI:10.4049/jimmunol.178.6.3837
Bryan N.B., Dorfleutner A., Rojanasakul Y., Stehlik C. (2009). Activation of inflammasomes requires intracellular redistribution of the apoptotic speck-like protein containing a caspase recruitment domain. J. Immunol. 182: 3173—3182. PMID 19234215 DOI:10.4049/jimmunol.0802367
Fernandes-Alnemri T., Yu J.W., Datta P., Wu J., Alnemri E.S. (2009). AIM2 activates the inflammasome and cell death in response to cytoplasmic DNA. Nature. 458: 509—513. PMID 19158676 DOI:10.1038/nature07710

Примітки[ред. | ред. код]

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16608 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9ULZ3 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також[ред. | ред. код]

Хромосома 16

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16608 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9ULZ3 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

PYCARD

Література[ред. | ред. код]

Примітки[ред. | ред. код]

Див. також[ред. | ред. код]

Навігаційне меню

Пошук