RAD17

RAD17
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3A1J, 3G65, 3GGR
Ідентифікатори
Символи	RAD17, CCYC, HR24L, RAD17SP, RAD24, RAD17 checkpoint clamp loader component
Зовнішні ІД	OMIM: 603139 MGI: 1333807 HomoloGene: 32117 GeneCards: RAD17
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • chromatin binding • DNA clamp loader activity Клітинна компонента • теломера • Rad17 RFC-like complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерце Біологічний процес • mitotic cell cycle checkpoint signaling • DNA replication checkpoint signaling • реплікація ДНК • DNA damage checkpoint signaling • клітинний цикл • regulation of phosphorylation • negative regulation of DNA replication • cellular response to DNA damage stimulus • mitotic DNA replication checkpoint signaling • GO:0100026 Репарація ДНК • regulation of signal transduction by p53 class mediator Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5884	19356
Ensembl	ENSG00000276618 ENSG00000152942	ENSMUSG00000021635
UniProt	O75943	Q6NXW6
RefSeq (мРНК)	NM_001278622 NM_002873 NM_133338 NM_133339 NM_133340 NM_133341 NM_133342 NM_133343 NM_133344	NM_001044371 NM_001283011 NM_011233
RefSeq (білок)	NP_001265551 NP_002864 NP_579916 NP_579917 NP_579918 NP_579919 NP_579920 NP_579921 NP_579922	NP_001037836 NP_001269940 NP_035363
Локус (UCSC)	Хр. 5: 69.37 – 69.41 Mb	Хр. 13: 100.75 – 100.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAD17 (англ. RAD17 checkpoint clamp loader component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 681 амінокислот, а молекулярна маса — 77 055.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKTFLRPKV		SSTKVTDWVD		PSFDDFLECS		GVSTITATSL		GVNNSSHRRK
NGPSTLESSR		FPARKRGNLS		SLEQIYGLEN		SKEYLSENEP		WVDKYKPETQ
HELAVHKKKI		EEVETWLKAQ		VLERQPKQGG		SILLITGPPG		CGKTTTLKIL
SKEHGIQVQE		WINPVLPDFQ		KDDFKGMFNT		ESSFHMFPYQ		SQIAVFKEFL
LRATKYNKLQ		MLGDDLRTDK		KIILVEDLPN		QFYRDSHTLH		EVLRKYVRIG
RCPLIFIISD		SLSGDNNQRL		LFPKEIQEEC		SISNISFNPV		APTIMMKFLN
RIVTIEANKN		GGKITVPDKT		SLELLCQGCS		GDIRSAINSL		QFSSSKGENN
LRPRKKGMSL		KSDAVLSKSK		RRKKPDRVFE		NQEVQAIGGK		DVSLFLFRAL
GKILYCKRAS		LTELDSPRLP		SHLSEYERDT		LLVEPEEVVE		MSHMPGDLFN
LYLHQNYIDF		FMEIDDIVRA		SEFLSFADIL		SGDWNTRSLL		REYSTSIATR
GVMHSNKARG		YAHCQGGGSS		FRPLHKPQWF		LINKKYRENC		LAAKALFPDF
CLPALCLQTQ		LLPYLALLTI		PMRNQAQISF		IQDIGRLPLK		RHFGRLKMEA
LTDREHGMID		PDSGDEAQLN		GGHSAEESLG		EPTQATVPET		WSLPLSQNSA
SELPASQPQP		FSAQGDMEEN		IIIEDYESDG		T

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, пошкодження ДНК, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• Dean F.B., Lian L., O'Donnell M. (1998). cDNA cloning and gene mapping of human homologs for Schizosaccharomyces pombe rad17, rad1, and hus1 and cloning of homologs from mouse, Caenorhabditis elegans, and Drosophila melanogaster. Genomics. 54: 424—436. PMID 9878245 DOI:10.1006/geno.1998.5587
• Parker A.E., Van de Weyer I., Laus M.C., Verhasselt P., Luyten W.H.M.L. (1998). Identification of a human homologue of the Schizosaccharomyces pombe rad17+ checkpoint gene. J. Biol. Chem. 273: 18340—18346. PMID 9660800 DOI:10.1074/jbc.273.29.18340
• Chen M.-S., Higashikubo R., Laszlo A., Roti Roti J. (2001). Multiple alternative splicing forms of human RAD17 and their differential response to ionizing radiation. Gene. 277: 145—152. PMID 11602352 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00692-8
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Rauen M., Burtelow M.A., Dufault V.M., Karnitz L.M. (2000). The human checkpoint protein hRad17 interacts with the PCNA-like proteins hRad1, hHus1, and hRad9. J. Biol. Chem. 275: 29767—29771. PMID 10884395 DOI:10.1074/jbc.M005782200
• Lindsey-Boltz L.A., Bermudez V.P., Hurwitz J., Sancar A. (2001). Purification and characterization of human DNA damage checkpoint Rad complexes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 11236—11241. PMID 11572977 DOI:10.1073/pnas.201373498

Див. також

• Хромосома 5