RAD23A

RAD23A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1DV0, 1F4I, 1IFY, 1OQY, 1P98, 1P9D, 1QZE, 1TP4, 2WYQ
Ідентифікатори
Символи	RAD23A, HHR23A, HR23A, RAD23 homolog A, nucleotide excision repair protein
Зовнішні ІД	OMIM: 600061 MGI: 105126 HomoloGene: 48322 GeneCards: RAD23A
Онтологія гена Молекулярна функція • single-stranded DNA binding • ubiquitin-specific protease binding • damaged DNA binding • polyubiquitin modification-dependent protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinase binding • ubiquitin binding • proteasome binding Клітинна компонента • Протеасома • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок • гіалоплазма • клітинне ядро • цитоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • nucleotide-excision repair • positive regulation of viral genome replication • GO:0022415 viral process • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein deubiquitination • protein destabilization • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • positive regulation of cell cycle Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5886	19358
Ensembl	ENSG00000179262	ENSMUSG00000003813
UniProt	P54725	P54726
RefSeq (мРНК)	NM_001270362 NM_001270363 NM_005053	NM_001297606 NM_001297607 NM_009010 NM_001378894 NM_001378895 NM_001378896
RefSeq (білок)	NP_001257291 NP_001257292 NP_005044	NP_001284535 NP_001284536 NP_033036 NP_001365823 NP_001365824 NP_001365825
Локус (UCSC)	Хр. 19: 12.95 – 12.95 Mb	Хр. 8: 85.56 – 85.57 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAD23A (англ. RAD23 homolog A, nucleotide excision repair protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 363 амінокислот, а молекулярна маса — 39 609.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVTITLKTL		QQQTFKIRME		PDETVKVLKE		KIEAEKGRDA		FPVAGQKLIY
AGKILSDDVP		IRDYRIDEKN		FVVVMVTKTK		AGQGTSAPPE		ASPTAAPESS
TSFPPAPTSG		MSHPPPAARE		DKSPSEESAP		TTSPESVSGS		VPSSGSSGRE
EDAASTLVTG		SEYETMLTEI		MSMGYERERV		VAALRASYNN		PHRAVEYLLT
GIPGSPEPEH		GSVQESQVSE		QPATEAAGEN		PLEFLRDQPQ		FQNMRQVIQQ
NPALLPALLQ		QLGQENPQLL		QQISRHQEQF		IQMLNEPPGE		LADISDVEGE
VGAIGEEAPQ		MNYIQVTPQE		KEAIERLKAL		GFPESLVIQA		YFACEKNENL
AANFLLSQNF		DDE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wang G., Sawai N., Kotliarova S., Kanazawa I., Nukina N. (2000). Ataxin-3, the MJD1 gene product, interacts with the two human homologs of yeast DNA repair protein RAD23, HHR23A and HHR23B. Hum. Mol. Genet. 9: 1795—1803. PMID 10915768 DOI:10.1093/hmg/9.12.1795
• Wang Q., Goh A.M., Howley P.M., Walters K.J. (2003). Ubiquitin recognition by the DNA repair protein hHR23a. Biochemistry. 42: 13529—13535. PMID 14621999 DOI:10.1021/bi035391j
• Raasi S., Pickart C.M. (2003). Rad23 ubiquitin-associated domains (UBA) inhibit 26 S proteasome-catalyzed proteolysis by sequestering lysine 48-linked polyubiquitin chains. J. Biol. Chem. 278: 8951—8959. PMID 12643283 DOI:10.1074/jbc.M212841200
• Raasi S., Orlov I., Fleming K.G., Pickart C.M. (2004). Binding of polyubiquitin chains to ubiquitin-associated (UBA) domains of HHR23A. J. Mol. Biol. 341: 1367—1379. PMID 15321727 DOI:10.1016/j.jmb.2004.06.057
• Chen L., Madura K. (2006). Evidence for distinct functions for human DNA repair factors hHR23A and hHR23B. FEBS Lett. 580: 3401—3408. PMID 16712842 DOI:10.1016/j.febslet.2006.05.012

Див. також

• Хромосома 19