RAD54B

RAD54B
Ідентифікатори
Символи	RAD54B, RDH54, RAD54 homolog B (S. cerevisiae), RAD54 homolog B
Зовнішні ІД	OMIM: 604289 MGI: 3605986 HomoloGene: 8240 GeneCards: RAD54B
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA helicase activity • DNA translocase activity • DNA binding • GO:0004003 DNA helicase activity • nucleotide binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • reciprocal meiotic recombination • mitotic recombination • GO:0100026 Репарація ДНК • cellular response to DNA damage stimulus • DNA duplex unwinding • double-strand break repair via homologous recombination • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25788	623474
Ensembl	ENSG00000197275	ENSMUSG00000078773
UniProt	Q9Y620 O95073	Q8BKE5 Q6PFE3
RefSeq (мРНК)	NM_001205262 NM_001205263 NM_006550 NM_012415 NM_134434	NM_001039556 NM_001256145 NM_177285
RefSeq (білок)	NP_001192191 NP_001192192 NP_036547 NP_001192191 NP_001192192 NP_036547	NP_001243071 NP_001034645 NP_001243074
Локус (UCSC)	Хр. 8: 94.37 – 94.48 Mb	Хр. 4: 11.56 – 11.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAD54B (англ. DNA repair and recombination protein RAD54B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 910 амінокислот, а молекулярна маса — 102 967.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRRSAAPSQL		QGNSFKKPKF		IPPGRSNPGL		NEEITKLNPD		IKLFEGVAIN
NTFLPSQNDL		RICSLNLPSE		ESTREINNRD		NCSGKYCFEA		PTLATLDPPH
TVHSAPKEVA		VSKEQEEKSD		SLVKYFSVVW		CKPSKKKHKK		WEGDAVLIVK
GKSFILKNLE		GKDIGRGIGY		KFKELEKIEE		GQTLMICGKE		IEVMGVISPD
DFSSGRCFQL		GGGSTAISHS		SQVARKCFSN		PFKSVCKPSS		KENRQNDFQN
CKPRHDPYTP		NSLVMPRPDK		NHQWVFNKNC		FPLVDVVIDP		YLVYHLRPHQ
KEGIIFLYEC		VMGMRMNGRC		GAILADEMGL		GKTLQCISLI		WTLQCQGPYG
GKPVIKKTLI		VTPGSLVNNW		KKEFQKWLGS		ERIKIFTVDQ		DHKVEEFIKS
IFYSVLIISY		EMLLRSLDQI		KNIKFDLLIC		DEGHRLKNSA		IKTTTALISL
SCEKRIILTG		TPIQNDLQEF		FALIDFVNPG		ILGSLSSYRK		IYEEPIILSR
EPSASEEEKE		LGERRAAELT		CLTGLFILRR		TQEIINKYLP		PKIENVVFCR
PGALQIELYR		KLLNSQVVRF		CLQGLLENSP		HLICIGALKK		LCNHPCLLFN
SIKEKECSST		CDKNEEKSLY		KGLLSVFPAD		YNPLLFTEKE		SGKLQVLSKL
LAVIHELRPT		EKVVLVSNYT		QTLNILQEVC		KRHGYAYTRL		DGQTPISQRQ
QIVDGFNSQH		SSFFIFLLSS		KAGGVGLNLI		GGSHLILYDI		DWNPATDIQA
MSRVWRDGQK		YPVHIYRLLT		TGTIEEKIYQ		RQISKQGLCG		AVVDLTKTSE
HIQFSVEELK		NLFTLHESSD		CVTHDLLDCE		CTGEEVHTGD		SLEKFIVSRD
CQLGPHHQKS		NSLKPLSMSQ		LKQWKHFSGD		HLNLTDPFLE		RITENVSFIF
QNITTQATGT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Tanaka K., Hiramoto T., Fukuda T., Miyagawa K. (2000). A novel human Rad54 homologue, Rad54B, associates with Rad51. J. Biol. Chem. 275: 26316—26321. PMID 10851248 DOI:10.1074/jbc.M910306199
• Tanaka K., Kagawa W., Kinebuchi T., Kurumizaka H., Miyagawa K. (2002). Human Rad54B is a double-stranded DNA-dependent ATPase and has biochemical properties different from its structural homolog in yeast, Tid1/Rdh54. Nucleic Acids Res. 30: 1346—1353. PMID 11884632 DOI:10.1093/nar/30.6.1346

Див. також

• Хромосома 8