RBBP4

RBBP4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XU7, 3GFC, 4PBY, 4PBZ, 4PC0, 4R7A, 5FXY
Ідентифікатори
Символи	RBBP4, NURF55, RBAP48, lin-53, retinoblastoma binding protein 4, RB binding protein 4, chromatin remodeling factor
Зовнішні ІД	OMIM: 602923 MGI: 1194912 HomoloGene: 21153 GeneCards: RBBP4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • ATP-dependent activity, acting on DNA • GO:0031493 histone binding • histone deacetylase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleosomal DNA binding • histone deacetylase activity Клітинна компонента • NuRD complex • ESC/E(Z) complex • CAF-1 complex • Sin3 complex • нуклеоплазма • NURF complex • клітинне ядро • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0061641 CENP-A containing chromatin assembly • transcription, DNA-templated • regulation of cell cycle • GO:0034723 DNA replication-dependent chromatin assembly • реплікація ДНК • negative regulation of gene expression, epigenetic • клітинний цикл • negative regulation of cell population proliferation • regulation of signal transduction by p53 class mediator • histone deacetylation • response to growth hormone • negative regulation of G0 to G1 transition • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5928	19646
Ensembl	ENSG00000162521	ENSMUSG00000057236
UniProt	Q09028	Q60972
RefSeq (мРНК)	NM_005610 NM_001135255 NM_001135256	NM_009030
RefSeq (білок)	NP_001128727 NP_001128728 NP_005601	NP_033056
Локус (UCSC)	Хр. 1: 32.65 – 32.69 Mb	Хр. 4: 129.2 – 129.23 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBBP4 (англ. RB binding protein 4, chromatin remodeling factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 425 амінокислот, а молекулярна маса — 47 656.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADKEAAFDD		AVEERVINEE		YKIWKKNTPF		LYDLVMTHAL		EWPSLTAQWL
PDVTRPEGKD		FSIHRLVLGT		HTSDEQNHLV		IASVQLPNDD		AQFDASHYDS
EKGEFGGFGS		VSGKIEIEIK		INHEGEVNRA		RYMPQNPCII		ATKTPSSDVL
VFDYTKHPSK		PDPSGECNPD		LRLRGHQKEG		YGLSWNPNLS		GHLLSASDDH
TICLWDISAV		PKEGKVVDAK		TIFTGHTAVV		EDVSWHLLHE		SLFGSVADDQ
KLMIWDTRSN		NTSKPSHSVD		AHTAEVNCLS		FNPYSEFILA		TGSADKTVAL
WDLRNLKLKL		HSFESHKDEI		FQVQWSPHNE		TILASSGTDR		RLNVWDLSKI
GEEQSPEDAE		DGPPELLFIH		GGHTAKISDF		SWNPNEPWVI		CSVSEDNIMQ
VWQMAENIYN		DEDPEGSVDP		EGQGS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, реплікація ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Verreault A., Kaufman P.D., Kobayashi R., Stillman B. (1996). Nucleosome assembly by a complex of CAF-1 and acetylated histones H3/H4. Cell. 87: 95—104. PMID 8858152 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81326-4
• Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. (1997). Histone deacetylases and SAP18, a novel polypeptide, are components of a human Sin3 complex. Cell. 89: 357—364. PMID 9150135 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80216-0
• Qian Y.-W., Lee E.Y.-H.P. (1995). Dual retinoblastoma-binding proteins with properties related to a negative regulator of ras in yeast. J. Biol. Chem. 270: 25507—25513. PMID 7503932 DOI:10.1074/jbc.270.43.25507
• Taunton J., Hassig C.A., Schreiber S.L. (1996). A mammalian histone deacetylase related to the yeast transcriptional regulator Rpd3p. Science. 272: 408—411. PMID 8602529 DOI:10.1126/science.272.5260.408
• Zhang Y., LeRoy G., Seelig H.-P., Lane W.S., Reinberg D. (1998). The dermatomyositis-specific autoantigen Mi2 is a component of a complex containing histone deacetylase and nucleosome remodeling activities. Cell. 95: 279—289. PMID 9790534 DOI:10.1016/S0092-8674(00)81758-4

Див. також

• Хромосома 1