RBBP5

RBBP5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3P4F, 4X8N, 4X8P, 5F6K, 5F6L
Ідентифікатори
Символи	RBBP5, RBQ3, SWD1, retinoblastoma binding protein 5, RB binding protein 5, histone lysine methyltransferase complex subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 600697 MGI: 1918367 HomoloGene: 3709 GeneCards: RBBP5
Онтологія гена Молекулярна функція • methylated histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone methyltransferase activity (H3-K4 specific) • histone-lysine N-methyltransferase activity Клітинна компонента • MLL1 complex • ядерце • MLL3/4 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • histone methyltransferase complex • Set1C/COMPASS complex Біологічний процес • response to estrogen • histone H3-K4 methylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • cellular response to DNA damage stimulus • beta-catenin-TCF complex assembly • посттрансляційна модифікація • regulation of megakaryocyte differentiation • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5929	213464
Ensembl	ENSG00000117222	ENSMUSG00000026439
UniProt	Q15291	Q8BX09
RefSeq (мРНК)	NM_001193272 NM_001193273 NM_005057	NM_172517 NM_001357486 NM_001357487
RefSeq (білок)	NP_001180201 NP_001180202 NP_005048	NP_766105 NP_001344415 NP_001344416
Локус (UCSC)	Хр. 1: 205.09 – 205.12 Mb	Хр. 1: 132.41 – 132.43 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBBP5 (англ. RB binding protein 5, histone lysine methyltransferase complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 538 амінокислот, а молекулярна маса — 59 153.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNLELLESFG		QNYPEEADGT		LDCISMALTC		TFNRWGTLLA		VGCNDGRIVI
WDFLTRGIAK		IISAHIHPVC		SLCWSRDGHK		LVSASTDNIV		SQWDVLSGDC
DQRFRFPSPI		LKVQYHPRDQ		NKVLVCPMKS		APVMLTLSDS		KHVVLPVDDD
SDLNVVASFD		RRGEYIYTGN		AKGKILVLKT		DSQDLVASFR		VTTGTSNTTA
IKSIEFARKG		SCFLINTADR		IIRVYDGREI		LTCGRDGEPE		PMQKLQDLVN
RTPWKKCCFS		GDGEYIVAGS		ARQHALYIWE		KSIGNLVKIL		HGTRGELLLD
VAWHPVRPII		ASISSGVVSI		WAQNQVENWS		AFAPDFKELD		ENVEYEERES
EFDIEDEDKS		EPEQTGADAA		EDEEVDVTSV		DPIAAFCSSD		EELEDSKALL
YLPIAPEVED		PEENPYGPPP		DAVQTSLMDE		GASSEKKRQS		SADGSQPPKK
KPKTTNIELQ		GVPNDEVHPL		LGVKGDGKSK		KKQAGRPKGS		KGKEKDSPFK
PKLYKGDRGL		PLEGSAKGKV		QAELSQPLTA		GGAISELL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee J.-H., Skalnik D.G. (2005). CpG-binding protein (CXXC finger protein 1) is a component of the mammalian Set1 histone H3-Lys4 methyltransferase complex, the analogue of the yeast Set1/COMPASS complex. J. Biol. Chem. 280: 41725—41731. PMID 16253997 DOI:10.1074/jbc.M508312200
• Lee J.-H., Tate C.M., You J.-S., Skalnik D.G. (2007). Identification and characterization of the human Set1B histone H3-Lys4 methyltransferase complex. J. Biol. Chem. 282: 13419—13428. PMID 17355966 DOI:10.1074/jbc.M609809200
• Lee J.H., Skalnik D.G. (2008). Wdr82 is a C-terminal domain-binding protein that recruits the Setd1A Histone H3-Lys4 methyltransferase complex to transcription start sites of transcribed human genes. Mol. Cell. Biol. 28: 609—618. PMID 17998332 DOI:10.1128/MCB.01356-07
• Patel A., Dharmarajan V., Vought V.E., Cosgrove M.S. (2009). On the mechanism of multiple lysine methylation by the human mixed lineage leukemia protein-1 (MLL1) core complex. J. Biol. Chem. 284: 24242—24256. PMID 19556245 DOI:10.1074/jbc.M109.014498

Див. також

• Хромосома 1