RBM15

RBM15
Ідентифікатори
Символи	RBM15, OTT, OTT1, SPEN, RNA binding motif protein 15, Putative RNA-binding protein 15
Зовнішні ІД	OMIM: 606077 MGI: 2443205 HomoloGene: 23383 GeneCards: RBM15
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • mRNA binding Клітинна компонента • nuclear speck • ядерна мембрана • мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear envelope • RNA N6-methyladenosine methyltransferase complex Біологічний процес • branching involved in blood vessel morphogenesis • ventricular septum morphogenesis • mRNA splicing, via spliceosome • placenta blood vessel development • GO:0022415 viral process • negative regulation of myeloid cell differentiation • spleen development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription of Notch receptor target • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • RNA methylation • dosage compensation by inactivation of X chromosome • thrombopoietin-mediated signaling pathway • regulation of megakaryocyte differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64783	229700
Ensembl	ENSG00000162775	ENSMUSG00000048109
UniProt	Q96T37	Q0VBL3
RefSeq (мРНК)	NM_001201545 NM_022768 NM_014092	NM_001045807
RefSeq (білок)	NP_001188474 NP_073605	NP_001039272
Локус (UCSC)	Хр. 1: 110.34 – 110.35 Mb	Хр. 3: 107.23 – 107.24 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBM15 (англ. RNA binding motif protein 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 977 амінокислот, а молекулярна маса — 107 189.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRTAGRDPVP		RRSPRWRRAV		PLCETSAGRR		VTQLRGDDLR		RPATMKGKER
SPVKAKRSRG		GEDSTSRGER		SKKLGGSGGS		NGSSSGKTDS		GGGSRRSLHL
DKSSSRGGSR		EYDTGGGSSS		SRLHSYSSPS		TKNSSGGGES		RSSSRGGGGE
SRSSGAASSA		PGGGDGAEYK		TLKISELGSQ		LSDEAVEDGL		FHEFKRFGDV
SVKISHLSGS		GSGDERVAFV		NFRRPEDARA		AKHARGRLVL		YDRPLKIEAV
YVSRRRSRSP		LDKDTYPPSA		SVVGASVGGH		RHPPGGGGGQ		RSLSPGGAAL
GYRDYRLQQL		ALGRLPPPPP		PPLPRDLERE		RDYPFYERVR		PAYSLEPRVG
AGAGAAPFRE		VDEISPEDDQ		RANRTLFLGN		LDITVTESDL		RRAFDRFGVI
TEVDIKRPSR		GQTSTYGFLK		FENLDMSHRA		KLAMSGKIII		RNPIKIGYGK
ATPTTRLWVG		GLGPWVPLAA		LAREFDRFGT		IRTIDYRKGD		SWAYIQYESL
DAAHAAWTHM		RGFPLGGPDR		RLRVDFADTE		HRYQQQYLQP		LPLTHYELVT
DAFGHRAPDP		LRGARDRTPP		LLYRDRDRDL		YPDSDWVPPP		PPVRERSTRT
AATSVPAYEP		LDSLDRRRDG		WSLDRDRGDR		DLPSSRDQPR		KRRLPEESGG
RHLDRSPESD		RPRKRHCAPS		PDRSPELSSS		RDRYNSDNDR		SSRLLLERPS
PIRDRRGSLE		KSQGDKRDRK		NSASAERDRK		HRTTAPTEGK		SPLKKEDRSD
GSAPSTSTAS		SKLKSPSQKQ		DGGTAPVASA		SPKLCLAWQG		MLLLKNSNFP
SNMHLLQGDL		QVASSLLVEG		STGGKVAQLK		ITQRLRLDQP		KLDEVTRRIK
VAGPNGYAIL		LAVPGSSDSR		SSSSSAASDT		ATSTQRPLRN		LVSYLKQKQA
AGVISLPVGG		NKDKENTGVL		HAFPPCEFSQ		QFLDSPAKAL		AKSEEDYLVM
IIVRGFGFQI		GVRYENKKRE		NLALTLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Lee J.H., Skalnik D.G. (2012). Rbm15-Mkl1 interacts with the Setd1b histone H3-Lys4 methyltransferase via a SPOC domain that is required for cytokine-independent proliferation. PLoS ONE. 7: E42965—E42965. PMID 22927943 DOI:10.1371/journal.pone.0042965

Див. також

• Хромосома 1