RBM17

RBM17
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2PE8, 2PEH
Ідентифікатори
Символи	RBM17, SPF45, RNA binding motif protein 17
Зовнішні ІД	OMIM: 606935 MGI: 1924188 HomoloGene: 13162 GeneCards: RBM17
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • mRNA processing • Альтернативний сплайсинг • Сплайсинг РНК • mRNA splicing, via spliceosome • GO:0100026 Репарація ДНК • regulation of RNA splicing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84991	76938
Ensembl	ENSG00000134453	ENSMUSG00000037197
UniProt	Q96I25	Q8JZX4
RefSeq (мРНК)	NM_032905 NM_001145547	NM_152824
RefSeq (білок)	NP_001139019 NP_116294	NP_690037
Локус (UCSC)	Хр. 10: 6.09 – 6.12 Mb	Хр. 2: 11.59 – 11.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBM17 (англ. RNA binding motif protein 17) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 401 амінокислот, а молекулярна маса — 44 962.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSLYDDLGVE		TSDSKTEGWS		KNFKLLQSQL		QVKKAALTQA		KSQRTKQSTV
LAPVIDLKRG		GSSDDRQIVD		TPPHVAAGLK		DPVPSGFSAG		EVLIPLADEY
DPMFPNDYEK		VVKRQREERQ		RQRELERQKE		IEEREKRRKD		RHEASGFARR
PDPDSDEDED		YERERRKRSM		GGAAIAPPTS		LVEKDKELPR		DFPYEEDSRP
RSQSSKAAIP		PPVYEEQDRP		RSPTGPSNSF		LANMGGTVAH		KIMQKYGFRE
GQGLGKHEQG		LSTALSVEKT		SKRGGKIIVG		DATEKDASKK		SDSNPLTEIL
KCPTKVVLLR		NMVGAGEVDE		DLEVETKEEC		EKYGKVGKCV		IFEIPGAPDD
EAVRIFLEFE		RVESAIKAVV		DLNGRYFGGR		VVKACFYNLD		KFRVLDLAEQ
V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lallena M.J., Chalmers K.J., Llamazares S., Lamond A.I., Valcarcel J. (2002). Splicing regulation at the second catalytic step by Sex-lethal involves 3' splice site recognition by SPF45. Cell. 109: 285—296. PMID 12015979 DOI:10.1016/S0092-8674(02)00730-4
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Див. також

• Хромосома 10