RBM25

RBM25
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3V53
Ідентифікатори
Символи	RBM25, NET52, RED120, RNPC7, S164, Snu71, fSAP94, RNA binding motif protein 25
Зовнішні ІД	OMIM: 612427 MGI: 1914289 HomoloGene: 136439 GeneCards: RBM25
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear speck • spliceosomal complex • клітинне ядро Біологічний процес • regulation of apoptotic process • mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	58517	67039
Ensembl	ENSG00000119707	ENSMUSG00000010608
UniProt	P49756	B2RY56
RefSeq (мРНК)	NM_021239	NM_027349 NM_001364415 NM_001364416
RefSeq (білок)	NP_067062	NP_081625 NP_001351344 NP_001351345
Локус (UCSC)	Хр. 14: 73.06 – 73.12 Mb	Хр. 12: 83.63 – 83.68 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBM25 (англ. RNA binding motif protein 25) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 843 амінокислот, а молекулярна маса — 100 185.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSFPPHLNRP		PMGIPALPPG		IPPPQFPGFP		PPVPPGTPMI		PVPMSIMAPA
PTVLVPTVSM		VGKHLGARKD		HPGLKAKEND		ENCGPTTTVF		VGNISEKASD
MLIRQLLAKC		GLVLSWKRVQ		GASGKLQAFG		FCEYKEPEST		LRALRLLHDL
QIGEKKLLVK		VDAKTKAQLD		EWKAKKKASN		GNARPETVTN		DDEEALDEET
KRRDQMIKGA		IEVLIREYSS		ELNAPSQESD		SHPRKKKKEK		KEDIFRRFPV
APLIPYPLIT		KEDINAIEME		EDKRDLISRE		ISKFRDTHKK		LEEEKGKKEK
ERQEIEKERR		ERERERERER		ERRERERERE		REREREKEKE		RERERERDRD
RDRTKERDRD		RDRERDRDRD		RERSSDRNKD		RSRSREKSRD		RERERERERE
RERERERERE		RERERERERE		REREREKDKK		RDREEDEEDA		YERRKLERKL
REKEAAYQER		LKNWEIRERK		KTREYEKEAE		REEERRREMA		KEAKRLKEFL
EDYDDDRDDP		KYYRGSALQK		RLRDREKEME		ADERDRKREK		EELEEIRQRL
LAEGHPDPDA		ELQRMEQEAE		RRRQPQIKQE		PESEEEEEEK		QEKEEKREEP
MEEEEEPEQK		PCLKPTLRPI		SSAPSVSSAS		GNATPNTPGD		ESPCGIIIPH
ENSPDQQQPE		EHRPKIGLSL		KLGASNSPGQ		PNSVKRKKLP		VDSVFNKFED
EDSDDVPRKR		KLVPLDYGED		DKNATKGTVN		TEEKRKHIKS		LIEKIPTAKP
ELFAYPLDWS		IVDSILMERR		IRPWINKKII		EYIGEEEATL		VDFVCSKVMA
HSSPQSILDD		VAMVLDEEAE		VFIVKMWRLL		IYETEAKKIG		LVK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates. J. Biol. Chem. 280: 5004—5012. PMID 15561718 DOI:10.1074/jbc.M411718200
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
• Zhou A., Ou A.C., Cho A., Benz E.J. Jr., Huang S.C. (2008). Novel splicing factor RBM25 modulates Bcl-x pre-mRNA 5' splice site selection. Mol. Cell. Biol. 28: 5924—5936. PMID 18663000 DOI:10.1128/MCB.00560-08

Див. також

• Хромосома 14