RBMX

RBMX
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MB0, 2MKS
Ідентифікатори
Символи	RBMX, HNRNPG, HNRPG, RBMXP1, RBMXRT, RNMX, hnRNP-G, MRXS11, RNA binding motif protein, X-linked, RNA binding motif protein X-linked
Зовнішні ІД	OMIM: 300199 MGI: 1343044 HomoloGene: 20494 GeneCards: RBMX
Пов'язані генетичні захворювання
syndromic X-linked intellectual disability Shashi type
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • mRNA binding • RNA binding • chromatin binding • protein domain specific binding • identical protein binding • single-stranded RNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • мембрана • supraspliceosomal complex • Нуклеоплазма • spliceosomal complex • екзосома • клітинне ядро • міжклітинний простір • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • transcription by RNA polymerase II • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • transcription, DNA-templated • negative regulation of mRNA splicing, via spliceosome • membrane protein ectodomain proteolysis • osteoblast differentiation • cellular response to interleukin-1 • protein homooligomerization • Сплайсинг РНК • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA metabolic process • protein complex oligomerization • mRNA splice site selection • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	27316	19655
Ensembl	ENSG00000147274	ENSMUSG00000031134
UniProt	P38159	Q9WV02
RefSeq (мРНК)	NM_001164803 NM_002139	NM_001166623 NM_011252
RefSeq (білок)	NP_001158275 NP_002130	NP_001160095 NP_035382
Локус (UCSC)	Хр. X: 136.85 – 136.88 Mb	Хр. X: 56.43 – 56.44 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBMX (англ. RNA binding motif protein, X-linked) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі X-хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 391 амінокислот, а молекулярна маса — 42 332.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVEADRPGKL		FIGGLNTETN		EKALEAVFGK		YGRIVEVLLM		KDRETNKSRG
FAFVTFESPA		DAKDAARDMN		GKSLDGKAIK		VEQATKPSFE		SGRRGPPPPP
RSRGPPRGLR		GGRGGSGGTR		GPPSRGGHMD		DGGYSMNFNM		SSSRGPLPVK
RGPPPRSGGP		PPKRSAPSGP		VRSSSGMGGR		APVSRGRDSY		GGPPRREPLP
SRRDVYLSPR		DDGYSTKDSY		SSRDYPSSRD		TRDYAPPPRD		YTYRDYGHSS
SRDDYPSRGY		SDRDGYGRDR		DYSDHPSGGS		YRDSYESYGN		SRSAPPTRGP
PPSYGGSSRY		DDYSSSRDGY		GGSRDSYSSS		RSDLYSSGRD		RVGRQERGLP
PSMERGYPPP		RDSYSSSSRG		APRGGGRGGS		RSDRGGGRSR		Y

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рибонуклеопротеїнів, активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транскрипція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Hofmann Y., Wirth B. (2002). hnRNP-G promotes exon 7 inclusion of survival motor neuron (SMN) via direct interaction with Htra2-beta1. Hum. Mol. Genet. 11: 2037—2049. PMID 12165565 DOI:10.1093/hmg/11.17.2037
• Nasim M.T., Chernova T.K., Chowdhury H.M., Yue B.G., Eperon I.C. (2003). HnRNP G and Tra2beta: opposite effects on splicing matched by antagonism in RNA binding. Hum. Mol. Genet. 12: 1337—1348. PMID 12761049 DOI:10.1093/hmg/ddg136
• Shin K.H., Kang M.K., Kim R.H., Christensen R., Park N.H. (2006). Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein G shows tumor suppressive effect against oral squamous cell carcinoma cells. Clin. Cancer Res. 12: 3222—3228. PMID 16707624 DOI:10.1158/1078-0432.CCR-05-2656
• Shin K.H., Kim R.H., Kim R.H., Kang M.K., Park N.H. (2008). hnRNP G elicits tumor-suppressive activity in part by upregulating the expression of Txnip. Biochem. Biophys. Res. Commun. 372: 880—885. PMID 18541147 DOI:10.1016/j.bbrc.2008.05.175

Див. також

• Хромосома X