RBPMS

RBPMS
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 5DET, 5CYJ
Ідентифікатори
Символи	RBPMS, HERMES, RNA binding protein with multiple splicing, RNA binding protein, mRNA processing factor
Зовнішні ІД	OMIM: 601558 MGI: 1334446 HomoloGene: 38238 GeneCards: RBPMS
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • poly(A) binding • nucleic acid binding • protein homodimerization activity • RNA binding • U1 snRNA binding • snRNA stem-loop binding • mRNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • P-body • cytoplasmic stress granule • U1 snRNP • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of pathway-restricted SMAD protein phosphorylation • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of SMAD protein signal transduction • GO:0001306 response to oxidative stress • mRNA splicing, via spliceosome • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11030	19663
Ensembl	ENSG00000157110	ENSMUSG00000031586
UniProt	Q93062	Q9WVB0
RefSeq (мРНК)	NM_001008710 NM_001008711 NM_001008712 NM_006867	NM_001042674 NM_001042675 NM_001286168 NM_019733
RefSeq (білок)	NP_001008710 NP_001008711 NP_001008712 NP_006858	NP_001036139 NP_001036140 NP_001273097 NP_062707
Локус (UCSC)	Хр. 8: 30.38 – 30.57 Mb	Хр. 8: 34.27 – 34.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBPMS (англ. RNA binding protein with multiple splicing) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 196 амінокислот, а молекулярна маса — 21 802.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNNGGKAEKE		NTPSEANLQE		EEVRTLFVSG		LPLDIKPREL		YLLFRPFKGY
EGSLIKLTSK		QPVGFVSFDS		RSEAEAAKNA		LNGIRFDPEI		PQTLRLEFAK
ANTKMAKNKL		VGTPNPSTPL		PNTVPQFIAR		EPYELTVPAL		YPSSPEVWAP
YPLYPAELAP		ALPPPAFTYP		ASLHAQMRWL		PPSEATSQGW		KSRQFC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
• Teplova M., Farazi T.A., Tuschl T., Patel D.J. (2015). Structural basis underlying CAC RNA recognition by the RRM domain of dimeric RNA-binding protein RBPMS. Q. Rev. Biophys. 2015: 1—11. PMID 26347403 DOI:10.1017/S0033583515000207

Див. також

• Хромосома 8