RECQL5

RECQL5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4BK0, 5LB8, 5LB5, 5LBA, 5LB3
Ідентифікатори
Символи	RECQL5, RECQ5, RecQ like helicase 5
Зовнішні ІД	OMIM: 603781 MGI: 2156841 HomoloGene: 31232 GeneCards: RECQL5
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA polymerase II complex binding • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • GO:0004003 DNA helicase activity • nucleic acid binding • hydrolase activity • ATP binding • DNA binding • GO:0043140 3'-5' DNA helicase activity • GO:1990163 four-way junction helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • RNA polymerase II, holoenzyme • нуклеоплазма • клітинне ядро • хромосома • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • DNA recombination • DNA metabolic process • negative regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter • cellular response to DNA damage stimulus • поділ клітини • chromosome separation • реплікація ДНК • клітинний цикл • GO:0100026 Репарація ДНК • DNA duplex unwinding • double-strand break repair via homologous recombination • cellular response to camptothecin • Сестринські хроматидні обміни • negative regulation of double-strand break repair via homologous recombination • GO:0007067 мітоз • mitotic sister chromatid segregation • response to X-ray • negative regulation of mitotic cell cycle • DNA unwinding involved in DNA replication • обмін речовин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9400	170472
Ensembl	ENSG00000108469	ENSMUSG00000020752
UniProt	O94762	Q8VID5
RefSeq (мРНК)	NM_001003715 NM_001003716 NM_004259	NM_130454
RefSeq (білок)	NP_001003715 NP_001003716 NP_004250	NP_569721
Локус (UCSC)	Хр. 17: 75.63 – 75.67 Mb	Хр. 11: 115.78 – 115.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RECQL5 (англ. RecQ like helicase 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 991 амінокислот, а молекулярна маса — 108 858.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSHHTTFPF		DPERRVRSTL		KKVFGFDSFK		TPLQESATMA		VVKGNKDVFV
CMPTGAGKSL		CYQLPALLAK		GITIVVSPLI		ALIQDQVDHL		LTLKVRVSSL
NSKLSAQERK		ELLADLEREK		PQTKILYITP		EMAASSSFQP		TLNSLVSRHL
LSYLVVDEAH		CVSQWGHDFR		PDYLRLGALR		SRLGHAPCVA		LTATATPQVQ
EDVFAALHLK		KPVAIFKTPC		FRANLFYDVQ		FKELISDPYG		NLKDFCLKAL
GQEADKGLSG		CGIVYCRTRE		ACEQLAIELS		CRGVNAKAYH		AGLKASERTL
VQNDWMEEKV		PVIVATISFG		MGVDKANVRF		VAHWNIAKSM		AGYYQESGRA
GRDGKPSWCR		LYYSRNDRDQ		VSFLIRKEVA		KLQEKRGNKA		SDKATIMAFD
ALVTFCEELG		CRHAAIAKYF		GDALPACAKG		CDHCQNPTAV		RRRLEALERS
SSWSKTCIGP		SQGNGFDPEL		YEGGRKGYGD		FSRYDEGSGG		SGDEGRDEAH
KREWNLFYQK		QMQLRKGKDP		KIEEFVPPDE		NCPLKEASSR		RIPRLTVKAR
EHCLRLLEEA		LSSNRQSTRT		ADEADLRAKA		VELEHETFRN		AKVANLYKAS
VLKKVADIHR		ASKDGQPYDM		GGSAKSCSAQ		AEPPEPNEYD		IPPASHVYSL
KPKRVGAGFP		KGSCPFQTAT		ELMETTRIRE		QAPQPERGGE		HEPPSRPCGL
LDEDGSEPLP		GPRGEVPGGS		AHYGGPSPEK		KAKSSSGGSS		LAKGRASKKQ
QLLATAAHKD		SQSIARFFCR		RVESPALLAS		APEAEGACPS		CEGVQGPPMA
PEKYTGEEDG		AGGHSPAPPQ		TEECLRERPS		TCPPRDQGTP		EVQPTPAKDT
WKGKRPRSQQ		ENPESQPQKR		PRPSAKPSVV		AEVKGSVSAS		EQGTLNPTAQ
DPFQLSAPGV		SLKEAANVVV		KCLTPFYKEG		KFASKELFKG		FARHLSHLLT
QKTSPGRSVK		EEAQNLIRHF		FHGRARCESE		ADWHGLCGPQ		R

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, реплікація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Sekelsky J.J., Brodsky M.H., Rubin G.M., Hawley R.S. (1999). Drosophila and human RecQ5 exist in different isoforms generated by alternative splicing. Nucleic Acids Res. 27: 3762—3769. PMID 10471747 DOI:10.1093/nar/27.18.3762
• Shimamoto A., Nishikawa K., Kitao S., Furuichi Y. (2000). Human RecQ5-beta, a large isomer of RecQ5 DNA helicase, localizes in the nucleoplasm and interacts with topoisomerases 3-alpha and 3-beta. Nucleic Acids Res. 28: 1647—1655. PMID 10710432 DOI:10.1093/nar/28.7.1647
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Blundred R., Myers K., Helleday T., Goldman A.S., Bryant H.E. (2010). Human RECQL5 overcomes thymidine-induced replication stress. DNA Repair. 9: 964—975. PMID 20643585 DOI:10.1016/j.dnarep.2010.06.009
• Islam M.N., Fox D. III, Guo R., Enomoto T., Wang W. (2010). RecQL5 promotes genome stabilization through two parallel mechanisms--interacting with RNA polymerase II and acting as a helicase. Mol. Cell. Biol. 30: 2460—2472. PMID 20231364 DOI:10.1128/MCB.01583-09
• Kassube S.A., Jinek M., Fang J., Tsutakawa S., Nogales E. (2013). Structural mimicry in transcription regulation of human RNA polymerase II by the DNA helicase RECQL5. Nat. Struct. Mol. Biol. 20: 892—899. PMID 23748380 DOI:10.1038/nsmb.2596

Див. також

• Хромосома 17