RFC5

RFC5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1LFS
Ідентифікатори
Символи	RFC5, RFC36, replication factor C subunit 5
Зовнішні ІД	OMIM: 600407 MGI: 1919401 HomoloGene: 6730 GeneCards: RFC5
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • DNA binding • GO:0043142 single-stranded DNA helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • enzyme binding • DNA clamp loader activity Клітинна компонента • DNA replication factor C complex • Ctf18 RFC-like complex • Нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • error-free translesion synthesis • error-prone translesion synthesis • positive regulation of DNA-directed DNA polymerase activity • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • nucleotide-excision repair, DNA incision • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • Реплікація ДНК • GO:0100026 Репарація ДНК • telomere maintenance via semi-conservative replication • DNA-dependent DNA replication • regulation of signal transduction by p53 class mediator Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5985	72151
Ensembl	ENSG00000111445	ENSMUSG00000029363
UniProt	P40937	Q9D0F6
RefSeq (мРНК)	NM_001130112 NM_001130113 NM_001206801 NM_007370 NM_181578 NM_001346815	NM_028128
RefSeq (білок)	NP_001123584 NP_001123585 NP_001193730 NP_001333744 NP_031396 NP_853556	NP_082404
Локус (UCSC)	Хр. 12: 118.01 – 118.03 Mb	Хр. 5: 117.52 – 117.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RFC5 (англ. Replication factor C subunit 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 340 амінокислот, а молекулярна маса — 38 497.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
METSALKQQE		QPAATKIRNL		PWVEKYRPQT		LNDLISHQDI		LSTIQKFINE
DRLPHLLLYG		PPGTGKTSTI		LACAKQLYKD		KEFGSMVLEL		NASDDRGIDI
IRGPILSFAS		TRTIFKKGFK		LVILDEADAM		TQDAQNALRR		VIEKFTENTR
FCLICNYLSK		IIPALQSRCT		RFRFGPLTPE		LMVPRLEHVV		EEEKVDISED
GMKALVTLSS		GDMRRALNIL		QSTNMAFGKV		TEETVYTCTG		HPLKSDIANI
LDWMLNQDFT		TAYRNITELK		TLKGLALHDI		LTEIHLFVHR		VDFPSSVRIH
LLTKMADIEY		RLSVGTNEKI		QLSSLIAAFQ		VTRDLIVAEA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як реплікація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у ядрі.

Література

• O'Donnell M., Onrust R., Dean F.B., Chen M., Hurwitz J. (1993). Homology in accessory proteins of replicative polymerases -- E. coli to humans. Nucleic Acids Res. 21: 1—3. PMID 8441605 DOI:10.1093/nar/21.1.1
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mossi R., Jonsson Z.O., Allen B.L., Hardin S.H., Huebscher U. (1997). Replication factor C interacts with the C-terminal side of proliferating cell nuclear antigen. J. Biol. Chem. 272: 1769—1776. PMID 8999859 DOI:10.1074/jbc.272.3.1769
• Lindsey-Boltz L.A., Bermudez V.P., Hurwitz J., Sancar A. (2001). Purification and characterization of human DNA damage checkpoint Rad complexes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 11236—11241. PMID 11572977 DOI:10.1073/pnas.201373498

Див. також

• Хромосома 12