RNF4

RNF4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EA6, 2XEU, 4PPE
Ідентифікатори
Символи	RNF4, SLX5, SNURF, RES4-26, ring finger protein 4
Зовнішні ІД	OMIM: 602850 MGI: 1201691 HomoloGene: 37711 GeneCards: RNF4
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • androgen receptor binding • identical protein binding • nucleosome binding • transferase activity • transcription factor binding • SUMO polymer binding • zinc ion binding • nuclear receptor coactivator activity Клітинна компонента • цитоплазма • PML body • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • androgen receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • protein K63-linked ubiquitination • response to arsenic-containing substance • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • protein K11-linked ubiquitination • regulation of kinetochore assembly • protein K48-linked ubiquitination • protein K6-linked ubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • regulation of spindle assembly • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein autoubiquitination Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6047	19822
Ensembl	ENSG00000063978	ENSMUSG00000029110
UniProt	P78317	Q9QZS2
RefSeq (мРНК)	NM_002938 NM_001185009 NM_001185010	NM_011278 NM_001304269 NM_001304270
RefSeq (білок)	NP_001171938 NP_001171939 NP_002929	NP_001291198 NP_001291199 NP_035408
Локус (UCSC)	Хр. 4: 2.46 – 2.63 Mb	Хр. 5: 34.49 – 34.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF4 (англ. Ring finger protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 190 амінокислот, а молекулярна маса — 21 319.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSTRKRRGGA		INSRQAQKRT		REATSTPEIS		LEAEPIELVE		TAGDEIVDLT
CESLEPVVVD		LTHNDSVVIV		DERRRPRRNA		RRLPQDHADS		CVVSSDDEEL
SRDRDVYVTT		HTPRNARDEG		ATGLRPSGTV		SCPICMDGYS		EIVQNGRLIV
STECGHVFCS		QCLRDSLKNA		NTCPTCRKKI		NHKRYHPIYI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Hadano S., Ishida Y., Ikeda J.-E. (1998). The primary structure and genomic organization of five novel transcripts located close to the Huntington's disease gene on human chromosome 4p16.3. DNA Res. 5: 177—186. PMID 9734812 DOI:10.1093/dnares/5.3.177
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kaiser F.J., Moeroey T., Chang G.T., Horsthemke B., Luedecke H.J. (2003). The RING finger protein RNF4, a co-regulator of transcription, interacts with the TRPS1 transcription factor. J. Biol. Chem. 278: 38780—38785. PMID 12885770 DOI:10.1074/jbc.M306259200
• Haekli M., Karvonen U., Jaenne O.A., Palvimo J.J. (2005). SUMO-1 promotes association of SNURF (RNF4) with PML nuclear bodies. Exp. Cell Res. 304: 224—233. PMID 15707587 DOI:10.1016/j.yexcr.2004.10.029
• Guo B., Sharrocks A.D. (2009). Extracellular signal-regulated kinase mitogen-activated protein kinase signaling initiates a dynamic interplay between sumoylation and ubiquitination to regulate the activity of the transcriptional activator PEA3. Mol. Cell. Biol. 29: 3204—3218. PMID 19307308 DOI:10.1128/MCB.01128-08
• Mukhopadhyay D., Arnaoutov A., Dasso M. (2010). The SUMO protease SENP6 is essential for inner kinetochore assembly. J. Cell Biol. 188: 681—692. PMID 20212317 DOI:10.1083/jcb.200909008

Див. також

• Хромосома 4