RNPC3

RNPC3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3EGN
Ідентифікатори
Символи	RNPC3, RBM40, RNP, SNRNP65, RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3, IGHD5, CPHD7
Зовнішні ІД	OMIM: 618016 MGI: 1914475 HomoloGene: 9746 GeneCards: RNPC3
Онтологія гена Молекулярна функція • U12 snRNA binding • pre-mRNA intronic binding • RNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • U12-type spliceosomal complex • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Сплайсинг РНК • GO:0007571 розвойовий процес Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55599	67225
Ensembl	ENSG00000185946	ENSMUSG00000027981
UniProt	Q96LT9	Q3UZ01
RefSeq (мРНК)	NM_017619	NM_001038696 NM_001287015 NM_026043
RefSeq (білок)	NP_060089	NP_001033785 NP_001273944 NP_080319
Локус (UCSC)	Хр. 1: 103.53 – 103.56 Mb	Хр. 3: 113.4 – 113.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNPC3 (англ. RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 517 амінокислот, а молекулярна маса — 58 575.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPEQPLAI		SRGCTSSSSL		SPPRGDRTLL		VRHLPAELTA		EEKEDLLKYF
GAQSVRVLSD		KGRLKHTAFA		TFPNEKAAIK		ALTRLHQLKL		LGHTLVVEFA
KEQDRVHSPC		PTSGSEKKKR		SDDPVEDDKE		KKELGYLTVE		NGIAPNHGLT
FPLNSCLKYM		YPPPSSTILA		NIVNALASVP		KFYVQVLHLM		NKMNLPTPFG
PITARPPMYE		DYMPLHAPLP		PTSPQPPEEP		PLPDEDEELS		SEESEYESTD
DEDRQRMNKL		MELANLQPKR		PKTIKQRHVR		KKRKIKDMLN		TPLCPSHSSL
HPVLLPSDVF		DQPQPVGNKR		IEFHISTDMP		AAFKKDLEKE		QNCEEKNHDL
PATEVDASNI		GFGKIFPKPN		LDITEEIKED		SDEMPSECIS		RRELEKGRIS
REEMETLSVF		RSYEPGEPNC		RIYVKNLAKH		VQEKDLKYIF		GRYVDFSSET
QRIMFDIRLM		KEGRMKGQAF		IGLPNEKAAA		KALKEANGYV		LFGKPMVVQF
ARSARPKQDP		KEGKRKC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Benecke H., Luehrmann R., Will C.L. (2005). The U11/U12 snRNP 65K protein acts as a molecular bridge, binding the U12 snRNA and U11-59K protein. EMBO J. 24: 3057—3069. PMID 16096647 DOI:10.1038/sj.emboj.7600765
• Netter C., Weber G., Benecke H., Wahl M.C. (2009). Functional stabilization of an RNA recognition motif by a noncanonical N-terminal expansion. RNA. 15: 1305—1313. PMID 19447915 DOI:10.1261/rna.1359909

Див. також

• Хромосома 1