RPAP2

RPAP2
Ідентифікатори
Символи	RPAP2, C1orf82, Rtr1, RNA polymerase II associated protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 611476 MGI: 2141142 HomoloGene: 11733 GeneCards: RPAP2
Онтологія гена Молекулярна функція • phosphoprotein phosphatase activity • зв'язування з іоном металу • hydrolase activity • RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity • protein serine/threonine phosphatase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase core enzyme binding Клітинна компонента • ядерце • RNA polymerase II, holoenzyme • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • snRNA transcription • transcription, DNA-templated • dephosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79871	231571
Ensembl	ENSG00000122484	ENSMUSG00000033773
UniProt	Q8IXW5	Q8VC34
RefSeq (мРНК)	NM_024813	NM_001163461 NM_001163462 NM_001289569 NM_001289570 NM_144911 NM_001359916 NM_001359917 NM_001359918
RefSeq (білок)	NP_079089	NP_001156933 NP_001156934 NP_001276498 NP_001276499 NP_659160 NP_001346845 NP_001346846 NP_001346847
Локус (UCSC)	Хр. 1: 92.3 – 92.4 Mb	Хр. 5: 107.75 – 107.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RPAP2 (англ. RNA polymerase II associated protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 612 амінокислот, а молекулярна маса — 69 509.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADFAGPSSA		GRKAGAPRCS		RKAAGTKQTS		TLKQEDASKR		KAELEAAVRK
KIEFERKALH		IVEQLLEENI		TEEFLMECGR		FITPAHYSDV		VDERSIVKLC
GYPLCQKKLG		IVPKQKYKIS		TKTNKVYDIT		ERKSFCSNFC		YQASKFFEAQ
IPKTPVWVRE		EERHPDFQLL		KEEQSGHSGE		EVQLCSKAIK		TSDIDNPSHF
EKQYESSSSS		THSDSSSDNE		QDFVSSILPG		NRPNSTNIRP		QLHQKSIMKK
KAGHKANSKH		KDKEQTVVDV		TEQLGDCKLD		SQEKDATCEL		PLQKVNTQSS
SNSTLPERLK		ASENSESEYS		RSEITLVGIS		KKSAEHFKRK		FAKSNQVSRS
VSSSVQVCPE		VGKRNLLKVL		KETLIEWKTE		ETLRFLYGQN		YASVCLKPEA
SLVKEELDED		DIISDPDSHF		PAWRESQNSL		DESLPFRGSG		TAIKPLPSYE
NLKKETEKLN		LRIREFYRGR		YVLGEETTKS		QDSEEHDSTF		PLIDSSSQNQ
IRKRIVLEKL		SKVLPGLLVP		LQITLGDIYT		QLKNLVRTFR		LTNRNIIHKP
AEWTLIAMVL		LSLLTPILGI		QKHSQEGMVF		TRFLDTLLEE		LHLKNEDLES
LTIIFRTSCL		PE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Egloff S., Zaborowska J., Laitem C., Kiss T., Murphy S. (2012). Ser7 phosphorylation of the CTD recruits the RPAP2 Ser5 phosphatase to snRNA genes. Mol. Cell. 45: 111—122. PMID 22137580 DOI:10.1016/j.molcel.2011.11.006

Див. також

• Хромосома 1