RPRD1B

RPRD1B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4FLA, 4FU3, 4HFG, 4NAD, 4Q94, 4Q96
Ідентифікатори
Символи	RPRD1B, C20orf77, CREPT, NET60, dJ1057B20.2, regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, Kub5-Hera, K-H
Зовнішні ІД	OMIM: 614694 MGI: 1917720 HomoloGene: 41426 GeneCards: RPRD1B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II complex binding • identical protein binding Клітинна компонента • RNA polymerase II, holoenzyme • центросома • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of cell population proliferation • regulation of cell cycle process • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • dephosphorylation of RNA polymerase II C-terminal domain • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase II • mRNA 3'-end processing Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	58490	70470
Ensembl	ENSG00000101413	ENSMUSG00000027651
UniProt	Q9NQG5	Q9CSU0
RefSeq (мРНК)	NM_021215	NM_001291134 NM_001291135 NM_001291136 NM_027434
RefSeq (білок)	NP_067038	NP_001278063 NP_001278064 NP_001278065 NP_081710
Локус (UCSC)	Хр. 20: 38.03 – 38.13 Mb	Хр. 2: 157.87 – 157.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RPRD1B (англ. Regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 326 амінокислот, а молекулярна маса — 36 900.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSFSESALE		KKLSELSNSQ		QSVQTLSLWL		IHHRKHAGPI		VSVWHRELRK
AKSNRKLTFL		YLANDVIQNS		KRKGPEFTRE		FESVLVDAFS		HVAREADEGC
KKPLERLLNI		WQERSVYGGE		FIQQLKLSME		DSKSPPPKAT		EEKKSLKRTF
QQIQEEEDDD		YPGSYSPQDP		SAGPLLTEEL		IKALQDLENA		ASGDATVRQK
IASLPQEVQD		VSLLEKITDK		EAAERLSKTV		DEACLLLAEY		NGRLAAELED
RRQLARMLVE		YTQNQKDVLS		EKEKKLEEYK		QKLARVTQVR		KELKSHIQSL
PDLSLLPNVT		GGLAPLPSAG		DLFSTD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20