RRAGD

RRAGD
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2Q3F
Ідентифікатори
Символи	RRAGD, RAGD, bA11D8.2.1, Ras related GTP binding D
Зовнішні ІД	OMIM: 608268 MGI: 1098604 HomoloGene: 49667 GeneCards: RRAGD
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity • GTP binding • GDP binding • protein heterodimerization activity • GTPase binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • лізосома • клітинне ядро • нуклеоплазма • центросома • Gtr1-Gtr2 GTPase complex Біологічний процес • positive regulation of TOR signaling • cellular response to amino acid stimulus • regulation of autophagy • regulation of macroautophagy • cellular response to leucine • positive regulation of TORC1 signaling • cellular response to leucine starvation • cellular response to starvation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	58528	52187
Ensembl	ENSG00000025039	ENSMUSG00000028278
UniProt	Q9NQL2	Q7TT45
RefSeq (мРНК)	NM_021244	NM_027491 NM_001369055
RefSeq (білок)	NP_067067	NP_081767 NP_001355984
Локус (UCSC)	Хр. 6: 89.36 – 89.41 Mb	Хр. 4: 32.98 – 33.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RRAGD (англ. Ras related GTP binding D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 400 амінокислот, а молекулярна маса — 45 588.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSQVLGKPQP		QDEDDAEEEE		EEDELVGLAD		YGDGPDSSDA		DPDSGTEEGV
LDFSDPFSTE		VKPRILLMGL		RRSGKSSIQK		VVFHKMSPNE		TLFLESTNKI
CREDVSNSSF		VNFQIWDFPG		QIDFFDPTFD		YEMIFRGTGA		LIFVIDSQDD
YMEALARLHL		TVTRAYKVNT		DINFEVFIHK		VDGLSDDHKI		ETQRDIHQRA
NDDLADAGLE		KIHLSFYLTS		IYDHSIFEAF		SKVVQKLIPQ		LPTLENLLNI
FISNSGIEKA		FLFDVVSKIY		IATDSTPVDM		QTYELCCDMI		DVVIDISCIY
GLKEDGAGTP		YDKESTAIIK		LNNTTVLYLK		EVTKFLALVC		FVREESFERK
GLIDYNFHCF		RKAIHEVFEV		RMKVVKSRKV		QNRLQKKKRA		TPNGTPRVLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, лізосомі.

Література

• Sekiguchi T., Hirose E., Nakashima N., Ii M., Nishimoto T. (2001). Novel G proteins, Rag C and Rag D, interact with GTP-binding proteins, Rag A and Rag B. J. Biol. Chem. 276: 7246—7257. PMID 11073942 DOI:10.1074/jbc.M004389200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Peng M., Yin N., Li M.O. (2014). Sestrins function as guanine nucleotide dissociation inhibitors for Rag GTPases to control mTORC1 signaling. Cell. 159: 122—133. PMID 25259925 DOI:10.1016/j.cell.2014.08.038

Див. також

• Хромосома 6