RREB1

RREB1
Ідентифікатори
Символи	RREB1, FINB, HNT, LZ321, RREB-1, Zep-1, ras responsive element binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602209 MGI: 2443664 HomoloGene: 2218 GeneCards: RREB1
Пов'язані генетичні захворювання
розсіяний склероз, макулодистрофія
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • ядерні тільця • екзосома • fibrillar center • клітинне ядро • цитоплазма • nuclear speck Біологічний процес • positive regulation of mammary gland epithelial cell proliferation • positive regulation of lamellipodium morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of epithelial cell migration • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • Ras protein signal transduction • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of wound healing, spreading of epidermal cells • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6239	68750
Ensembl	ENSG00000124782	ENSMUSG00000039087
UniProt	Q92766	Q3UH06
RefSeq (мРНК)	NM_001003698 NM_001003699 NM_001003700 NM_001168344 NM_002955	NM_001013392 NM_001039188 NM_001177868 NM_001177869 NM_026830
RefSeq (білок)	NP_001003698 NP_001003699 NP_001003700 NP_001161816 NP_001003698.1 NP_001161816.1	NP_001034277 NP_001171339 NP_001171340 NP_081106 NP_001391686 NP_001391687 NP_001391688 NP_001391689
Локус (UCSC)	Хр. 6: 7.11 – 7.25 Mb	Хр. 13: 37.96 – 38.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RREB1 (англ. Ras responsive element binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 687 амінокислот, а молекулярна маса — 181 420.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSSSPAGLE		GSDLSSINTM		MSAVMSVGKV		TENGGSPQGI		KSPSKPPGPN
RIGRRNQETK		EEKSSYNCPL		CEKICTTQHQ		LTMHIRQHNT		DTGGADHSCS
ICGKSLSSAS		SLDRHMLVHS		GERPYKCTVC		GQSFTTNGNM		HRHMKIHEKD
PNSATATAPP		SPLKRRRLSS		KRKLSHDAES		EREDPAPAKK		MVEDGQSGDL
EKKADEVFHC		PVCFKEFVCK		YGLETHMETH		SDNPLRCDIC		CVTFRTHRGL
LRHNALVHKQ		LPRDAMGRPF		IQNNPSIPAG		FHDLGFTDFS		CRKFPRISQA
WCETNLRRCI		SEQHRFVCDT		CDKAFPMLCS		LALHKQTHVA		ADQGQEKPQA
TPLPGDALDQ		KGFLALLGLQ		HTKDVRPAPA		EEPLPDDNQA		IQLQTLKCQL
PQDPGCTNLL		SLSPFEAASL		GGSLTVLPAT		KDSIKHLSLQ		PFQKGFIIQP
DSSIVVKPIS		GESAIELADI		QQILKMAASA		PPQISLPPFS		KAPAAPLQAI
FKHMPPLKPK		PLVTPRTVVA		TSTPPPLINA		QQASPGCISP		SLPPPPLKLL
KGSVEAASNA		HLLQSKSGTQ		PHAATRLSLQ		QPRAELPGQP		EMKTQLEQDS
IIEALLPLSM		EAKIKQEITE		GELKAFMTAP		GGKKTPAMRK		VLYPCRFCNQ
VFAFSGVLRA		HVRSHLGISP		YQCNICDYIA		ADKAALIRHL		RTHSGERPYI
CKICHYPFTV		KANCERHLRK		KHLKATRKDI		EKNIEYVSSS		AAELVDAFCA
PDTVCRLCGE		DLKHYRALRI		HMRTHCGRGL		GGGHKGRKPF		ECKECSAAFA
AKRNCIHHIL		KQHLHVPEQD		IESYVLAADG		LGPAEAPAAE		ASGRGEDSGC
AALGDCKPLT		AFLEPQNGFL		HRGPTQPPPP		HVSIKLEPAS		SFAVDFNEPL
DFSQKGLALV		QVKQENISFL		SPSSLVPYDC		SMEPIDLSIP		KNFRKGDKDL
ATPSEAKKPE		EEAGSSEQPS		PCPAPGPSLP		VTLGPSGILE		SPMAPAPAAT
PEPPAQPLQG		PVQLAVPIYS		SALVSSPPLV		GSSALLSGTA		LLRPLRPKPP
LLLPKPPVTE		ELPPLASIAQ		IISSVSSAPT		LLKTKVADPG		PASTGSNTTA
SDSLGGSVPK		AATTATPAAT		TSPKESSEPP		APASSPEAAS		PTEQGPAGTS
KKRGRKRGMR		SRPRANSGGV		DLDSSGEFAS		IEKMLATTDT		NKFSPFLQTA
EDNTQDEVAG		APADHHGPSD		EEQGSPPEDK		LLRAKRNSYT		NCLQKITCPH
CPRVFPWASS		LQRHMLTHTD		SQSDAETAAA		AGEVLDLTSR		DREQPSEGAT
ELRQVAGDAP		VEQATAETAS		PVHREEHGRG		ESHEPEEEHG		TEESTGDADG
AEEDASSNQS		LDLDFATKLM		DFKLAEGDGE		AGAGGAASQE		QKLACDTCGK
SFKFLGTLSR		HRKAHGRQEP		KDEKGDGAST		AEEGPQPAPE		QEEKPPETPA
EVVESAPGAG		EAPAEKLAEE		TEGPSDGESA		AEKRSSEKSD		DDKKPKTDSP
KSVASKADKR		KKVCSVCNKR		FWSLQDLTRH		MRSHTGERPY		KCQTCERTFT
LKHSLVRHQR		IHQKARHAKH		HGKDSDKEER		GEEDSENEST		HSGNNAVSEN
EAELAPNASN		HMAVTRSRKE		GLASATKDCS		HREEKVTAGW		PSEPGQGDLN
PESPAALGQD		LLEPRSKRPA		HPILATADGA		SQLVGME

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Fujimoto-Nishiyama A., Ishii S., Matsuda S., Inoue J., Yamamoto T. (1997). A novel zinc finger protein, Finb, is a transcriptional activator and localized in nuclear bodies. Gene. 195: 267—275. PMID 9305772 DOI:10.1016/S0378-1119(97)00172-8
• Nitz M.D., Harding M.A., Smith S.C., Thomas S., Theodorescu D. (2011). RREB1 transcription factor splice variants in urologic cancer. Am. J. Pathol. 179: 477—486. PMID 21703425 DOI:10.1016/j.ajpath.2011.03.038
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang L., Zhao J., Edenberg H.J. (1999). A human Raf-responsive zinc-finger protein that binds to divergent sequences. Nucleic Acids Res. 27: 2947—2956. PMID 10390538 DOI:10.1093/nar/27.14.2947
• Ray S.K., Nishitani J., Petry M.W., Fessing M.Y., Leiter A.B. (2003). Novel transcriptional potentiation of BETA2/NeuroD on the secretin gene promoter by the DNA-binding protein Finb/RREB-1. Mol. Cell. Biol. 23: 259—271. PMID 12482979 DOI:10.1128/MCB.23.1.259-271.2003
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Див. також

• Хромосома 6