RRN3

RRN3
Ідентифікатори
Символи	RRN3, A-270G1.2, TIFIA, RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor
Зовнішні ІД	OMIM: 605121 MGI: 1925255 HomoloGene: 39531 GeneCards: RRN3
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA polymerase binding • GO:0001187 RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase I core binding • RNA polymerase I general transcription initiation factor activity Клітинна компонента • ядерце • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • in utero embryonic development • GO:0007576 nucleolus organization • positive regulation of neuron projection development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • проліферація • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • DNA-templated transcription, initiation • regulation of DNA-templated transcription, initiation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • cytoplasm organization • transcription, DNA-templated • homeostasis of number of cells • transcription initiation from RNA polymerase I promoter • ribosome biogenesis • regulation of transcription by RNA polymerase I • RNA polymerase I preinitiation complex assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54700	106298
Ensembl	ENSG00000085721 ENSG00000278494	ENSMUSG00000022682
UniProt	Q9NYV6	B2RS91
RefSeq (мРНК)	NM_001301064 NM_018427	NM_001039521
RefSeq (білок)	NP_001287993 NP_060897	NP_001034610
Локус (UCSC)	Хр. 16: 15.06 – 15.09 Mb	Хр. 16: 13.6 – 13.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RRN3 (англ. RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 651 амінокислот, а молекулярна маса — 74 107.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAPLLHTRL		PGDAAASSSA		VKKLGASRTG		ISNMRALEND		FFNSPPRKTV
RFGGTVTEVL		LKYKKGETND		FELLKNQLLD		PDIKDDQIIN		WLLEFRSSIM
YLTKDFEQLI		SIILRLPWLN		RSQTVVEEYL		AFLGNLVSAQ		TVFLRPCLSM
IASHFVPPRV		IIKEGDVDVS		DSDDEDDNLP		ANFDTCHRAL		QIIARYVPST
PWFLMPILVE		KFPFVRKSER		TLECYVHNLL		RISVYFPTLR		HEILELIIEK
LLKLDVNASR		QGIEDAEETA		TQTCGGTDST		EGLFNMDEDE		ETEHETKAGP
ERLDQMVHPV		AERLDILMSL		VLSYMKDVCY		VDGKVDNGKT		KDLYRDLINI
FDKLLLPTHA		SCHVQFFMFY		LCSFKLGFAE		AFLEHLWKKL		QDPSNPAIIR
QAAGNYIGSF		LARAKFIPLI		TVKSCLDLLV		NWLHIYLNNQ		DSGTKAFCDV
ALHGPFYSAC		QAVFYTFVFR		HKQLLSGNLK		EGLQYLQSLN		FERIVMSQLN
PLKICLPSVV		NFFAAITNKY		QLVFCYTIIE		RNNRQMLPVI		RSTAGGDSVQ
ICTNPLDTFF		PFDPCVLKRS		KKFIDPIYQV		WEDMSAEELQ		EFKKPMKKDI
VEDEDDDFLK		GEVPQNDTVI		GITPSSFDTH		FRSPSSSVGS		PPVLYMQPSP
L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Moorefield B., Greene E.A., Reeder R.H. (2000). RNA polymerase I transcription factor Rrn3 is functionally conserved between yeast and human. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 4724—4729. PMID 10758157 DOI:10.1073/pnas.080063997
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yuan X., Zhao J., Zentgraf H., Hoffmann-Rohrer U., Grummt I. (2002). Multiple interactions between RNA polymerase I, TIF-IA and TAF(I) subunits regulate preinitiation complex assembly at the ribosomal gene promoter. EMBO Rep. 3: 1082—1087. PMID 12393749 DOI:10.1093/embo-reports/kvf212
• Mayer C., Bierhoff H., Grummt I. (2005). The nucleolus as a stress sensor: JNK2 inactivates the transcription factor TIF-IA and down-regulates rRNA synthesis. Genes Dev. 19: 933—941. PMID 15805466 DOI:10.1101/gad.333205

Див. також

• Хромосома 16