RSPO1

RSPO1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4BSO, 4BSP, 4BSR, 4BSS, 4BST, 4BSU, 4CDK, 4KNG, 4KT1, 4LI2, 4QXF
Ідентифікатори
Символи	RSPO1, CRISTIN3, RSPO, R-spondin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 609595 MGI: 2183426 HomoloGene: 52148 GeneCards: RSPO1
Пов'язані генетичні захворювання
palmoplantar keratoderma-XX sex reversal-predisposition to squamous cell carcinoma syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • heparin binding • signaling receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • G protein-coupled receptor binding • GO:0005110 frizzled binding Клітинна компонента • extracellular region • клітинне ядро • міжклітинний простір Біологічний процес • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of Wnt signaling pathway • regulation of receptor internalization • positive regulation of protein phosphorylation • Wnt signaling pathway • відповідь на стимул Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	284654	192199
Ensembl	ENSG00000169218	ENSMUSG00000028871
UniProt	Q2MKA7	Q9Z132
RefSeq (мРНК)	NM_001038633 NM_001242908 NM_001242909 NM_001242910 NM_173640	NM_138683
RefSeq (білок)	NP_001033722 NP_001229837 NP_001229838 NP_001229839	NP_619624
Локус (UCSC)	Хр. 1: 37.61 – 37.63 Mb	Хр. 4: 124.88 – 124.9 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RSPO1 (англ. R-spondin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 263 амінокислот, а молекулярна маса — 28 959.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRLGLCVVAL		VLSWTHLTIS		SRGIKGKRQR		RISAEGSQAC		AKGCELCSEV
NGCLKCSPKL		FILLERNDIR		QVGVCLPSCP		PGYFDARNPD		MNKCIKCKIE
HCEACFSHNF		CTKCKEGLYL		HKGRCYPACP		EGSSAANGTM		ECSSPAQCEM
SEWSPWGPCS		KKQQLCGFRR		GSEERTRRVL		HAPVGDHAAC		SDTKETRRCT
VRRVPCPEGQ		KRRKGGQGRR		ENANRNLARK		ESKEAGAGSR		RRKGQQQQQQ
QGTVGPLTSA		GPA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину. Локалізований у ядрі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chen P.H., Chen X., Lin Z., Fang D., He X. (2013). The structural basis of R-spondin recognition by LGR5 and RNF43. Genes Dev. 27: 1345—1350. PMID 23756651 DOI:10.1101/gad.219915.113

Див. також

• Хромосома 1