SARNP

SARNP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DO1
Ідентифікатори
Символи	SARNP, CIP29, HCC1, HSPC316, THO1, SAP domain containing ribonucleoprotein
Зовнішні ІД	OMIM: 610049 MGI: 1913368 HomoloGene: 41628 GeneCards: SARNP
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • protein C-terminus binding • RS domain binding Клітинна компонента • nuclear speck • transcription export complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • cytoplasmic ribonucleoprotein granule Біологічний процес • mRNA transport • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of translation • transcription, DNA-templated • RNA export from nucleus • mRNA export from nucleus • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA 3'-end processing • GO:0015915 транспорт • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84324	66118
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000078427
UniProt	P82979	Q9D1J3
RefSeq (мРНК)	NM_033082	NM_025364
RefSeq (білок)	NP_149073	NP_079640 NP_001346332 NP_001346333 NP_001346334 NP_001346335 NP_001346336
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 10: 128.82 – 128.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SARNP (англ. SAP domain containing ribonucleoprotein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 210 амінокислот, а молекулярна маса — 23 671.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATETVELHK		LKLAELKQEC		LARGLETKGI		KQDLIHRLQA		YLEEHAEEEA
NEEDVLGDET		EEEETKPIEL		PVKEEEPPEK		TVDVAAEKKV		VKITSEIPQT
ERMQKRAERF		NVPVSLESKK		AARAARFGIS		SVPTKGLSSD		NKPMVNLDKL
KERAQRFGLN		VSSISRKSED		DEKLKKRKER		FGIVTSSAGT		GTTEDTEAKK
RKRAERFGIA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Fukuda S., Wu D.W., Stark K., Pelus L.M. (2002). Cloning and characterization of a proliferation-associated cytokine-inducible protein, CIP29. Biochem. Biophys. Res. Commun. 292: 593—600. PMID 11922608 DOI:10.1006/bbrc.2002.6680
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Leaw C.L., Ren E.C., Choong M.L. (2004). Hcc-1 is a novel component of the nuclear matrix with growth inhibitory function. Cell. Mol. Life Sci. 61: 2264—2273. PMID 15338056 DOI:10.1007/s00018-004-4205-x
• Sugiura T., Sakurai K., Nagano Y. (2007). Intracellular characterization of DDX39, a novel growth-associated RNA helicase. Exp. Cell Res. 313: 782—790. PMID 17196963 DOI:10.1016/j.yexcr.2006.11.014

Див. також

• Хромосома 12