SCAF11

SCAF11
Ідентифікатори
Символи	SCAF11, CASP11, SFRS2IP, SIP1, SRRP129, SRSF2IP, SR-related CTD associated factor 11
Зовнішні ІД	OMIM: 603668 MGI: 1919443 HomoloGene: 37957 GeneCards: SCAF11
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • RNA binding;
Клітинна компонента	• ядерце; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • ядерні тільця;
Біологічний процес	• RNA splicing, via transesterification reactions; • mRNA processing; • spliceosomal complex assembly; • Сплайсинг РНК;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	9169
	72193
	ENSG00000139218
	ENSMUSG00000033228
	Q99590
	н/д
	NM_004719
	NM_028148
	NP_004710
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SCAF11 (англ. SR-related CTD associated factor 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 463 амінокислот, а молекулярна маса — 164 652^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKKKTVCTLN	MGDKKYEDME	GEENGDNTIS	TGLLYSEADR	CPICLNCLLE
KEVGFPESCN	HVFCMTCILK	WAETLASCPI	DRKPFQAVFK	FSALEGYVKV
QVKKQLRETK	DKKNENSFEK	QVSCHENSKS	CIRRKAIVRE	DLLSAKVCDL
KWIHRNSLYS	ETGGKKNAAI	KINKPQRSNW	STNQCFRNFF	SNMFSSVSHS
GESSFTYRAY	CTEFIEASEI	SALIRQKRHE	LELSWFPDTL	PGIGRIGFIP
WNVETEVLPL	ISSVLPRTIF	PTSTISFEHF	GTSCKGYALA	HTQEGEEKKQ
TSGTSNTRGS	RRKPAMTTPT	RRSTRNTRAE	TASQSQRSPI	SDNSGCDAPG
NSNPSLSVPS	SAESEKQTRQ	APKRKSVRRG	RKPPLLKKKL	RSSVAAPEKS
SSNDSVDEET	AESDTSPVLE	KEHQPDVDSS	NICTVQTHVE	NQSANCLKSC
NEQIEESEKH	TANYDTEERV	GSSSSESCAQ	DLPVLVGEEG	EVKKLENTGI
EANVLCLESE	ISENILEKGG	DPLEKQDQIS	GLSQSEVKTD	VCTVHLPNDF
PTCLTSESKV	YQPVSCPLSD	LSENVESVVN	EEKITESSLV	EITEHKDFTL
KTEELIESPK	LESSEGEIIQ	TVDRQSVKSP	EVQLLGHVET	EDVEIIATCD
TFGNEDFNNI	QDSENNLLKN	NLLNTKLEKS	LEEKNESLTE	HPRSTELPKT
HIEQIQKHFS	EDNNEMIPME	CDSFCSDQNE	SEVEPSVNAD	LKQMNENSVT
HCSENNMPSS	DLADEKVETV	SQPSESPKDT	IDKTKKPRTR	RSRFHSPSTT
WSPNKDTPQE	KKRPQSPSPR	RETGKESRKS	QSPSPKNESA	RGRKKSRSQS
PKKDIARERR	QSQSRSPKRD	TTRESRRSES	LSPRRETSRE	NKRSQPRVKD
SSPGEKSRSQ	SRERESDRDG	QRRERERRTR	KWSRSRSHSR	SPSRCRTKSK
SSSFGRIDRD	SYSPRWKGRW	ANDGWRCPRG	NDRYRKNDPE	KQNENTRKEK
NDIHLDADDP	NSADKHRNDC	PNWITEKINS	GPDPRTRNPE	KLKESHWEEN
RNENSGNSWN	KNFGSGWVSN	RGRGRGNRGR	GTYRSSFAYK	DQNENRWQNR
KPLSGNSNSS	GSESFKFVEQ	QSYKRKSEQE	FSFDTPADRS	GWTSASSWAV
RKTLPADVQN	YYSRRGRNSS	GPQSGWMKQE	EETSGQDSSL	KDQTNQQVDG
SQLPINMMQP	QMNVMQQQMN	AQHQPMNIFP	YPVGVHAPLM	NIQRNPFNIH
PQLPLHLHTG	VPLMQVATPT	SVSQGLPPPP	PPPPPSQQVN	YIASQPDGKQ
LQGIPSSSHV	SNNMSTPVLP	APTAAPGNTG	MVQGPSSGNT	SSSSHSKASN
AAVKLAESKV	SVAVEASADS	SKTDKKLQIQ	EKAAQEVKLA	IKPFYQNKDI
TKEEYKEIVR	KAVDKVCHSK	SGEVNSTKVA	NLVKAYVDKY	KYSRKGSQKK
TLEEPVSTEK	NIG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

Zhang W.-J., Wu J.Y. (1998). Sip1, a novel RS domain-containing protein essential for pre-mRNA splicing. Mol. Cell. Biol. 18: 676—684. PMID 9447963 DOI:10.1128/MCB.18.2.676
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
Tanner S., Stagljar I., Georgiev O., Schaffner W., Bourquin J.-P. (1997). A novel SR-related protein specifically interacts with the carboxy-terminal domain (CTD) of RNA polymerase II through a conserved interaction domain. Biol. Chem. 378: 565—571. PMID 9224939

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10784 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q99590 (англ.) . Архів оригіналу за 15 січня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10784 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q99590 (англ.) . Архів оригіналу за 15 січня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

SCAF11

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук