SCAP (ген)

SCAP
Ідентифікатори
Символи	SCAP, entrez:22937, SREBF chaperone
Зовнішні ІД	OMIM: 601510 MGI: 2135958 HomoloGene: 8160 GeneCards: SCAP
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cholesterol binding • unfolded protein binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • sterol binding Клітинна компонента • endoplasmic reticulum membrane • ER to Golgi transport vesicle membrane • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • Golgi membrane • ендоплазматичний ретикулум • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • response to hypoxia • GO:0010260 старіння людини • cholesterol metabolic process • response to insulin • regulation of fatty acid biosynthetic process • negative regulation of cholesterol biosynthetic process • steroid metabolic process • lipid metabolism • regulation of fatty acid metabolic process • SREBP signaling pathway • regulation of cholesterol biosynthetic process • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • cellular lipid metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22937	235623
Ensembl	ENSG00000114650	ENSMUSG00000032485
UniProt	Q12770	Q6GQT6
RefSeq (мРНК)	NM_012235 NM_001320044	NM_001001144 NM_001103162
RefSeq (білок)	NP_001306973 NP_036367	NP_001001144 NP_001096632
Локус (UCSC)	Хр. 3: 47.41 – 47.48 Mb	Хр. 9: 110.16 – 110.21 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCAP (англ. SREBF chaperone) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 279 амінокислот, а молекулярна маса — 139 729.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTLTERLREK		ISRAFYNHGL		LCASYPIPII		LFTGFCILAC		CYPLLKLPLP
GTGPVEFTTP		VKDYSPPPVD		SDRKQGEPTE		QPEWYVGAPV		AYVQQIFVKS
SVFPWHKNLL		AVDVFRSPLS		RAFQLVEEIR		NHVLRDSSGI		RSLEELCLQV
TDLLPGLRKL		RNLLPEHGCL		LLSPGNFWQN		DWERFHADPD		IIGTIHQHEP
KTLQTSATLK		DLLFGVPGKY		SGVSLYTRKR		MVSYTITLVF		QHYHAKFLGS
LRARLMLLHP		SPNCSLRAES		LVHVHFKEEI		GVAELIPLVT		TYIILFAYIY
FSTRKIDMVK		SKWGLALAAV		VTVLSSLLMS		VGLCTLFGLT		PTLNGGEIFP
YLVVVIGLEN		VLVLTKSVVS		TPVDLEVKLR		IAQGLSSESW		SIMKNMATEL
GIILIGYFTL		VPAIQEFCLF		AVVGLVSDFF		LQMLFFTTVL		SIDIRRMELA
DLNKRLPPEA		CLPSAKPVGQ		PTRYERQLAV		RPSTPHTITL		QPSSFRNLRL
PKRLRVVYFL		ARTRLAQRLI		MAGTVVWIGI		LVYTDPAGLR		NYLAAQVTEQ
SPLGEGALAP		MPVPSGMLPP		SHPDPAFSIF		PPDAPKLPEN		QTSPGESPER
GGPAEVVHDS		PVPEVTWGPE		DEELWRKLSF		RHWPTLFSYY		NITLAKRYIS
LLPVIPVTLR		LNPREALEGR		HPQDGRSAWP		PPGPIPAGHW		EAGPKGPGGV
QAHGDVTLYK		VAALGLATGI		VLVLLLLCLY		RVLCPRNYGQ		LGGGPGRRRR
GELPCDDYGY		APPETEIVPL		VLRGHLMDIE		CLASDGMLLV		SCCLAGHVCV
WDAQTGDCLT		RIPRPGRQRR		DSGVGSGLEA		QESWERLSDG		GKAGPEEPGD
SPPLRHRPRG		PPPPSLFGDQ		PDLTCLIDTN		FSAQPRSSQP		TQPEPRHRAV
CGRSRDSPGY		DFSCLVQRVY		QEEGLAAVCT		PALRPPSPGP		VLSQAPEDEG
GSPEKGSPSL		AWAPSAEGSI		WSLELQGNLI		VVGRSSGRLE		VWDAIEGVLC
CSSEEVSSGI		TALVFLDKRI		VAARLNGSLD		FFSLETHTAL		SPLQFRGTPG
RGSSPASPVY		SSSDTVACHL		THTVPCAHQK		PITALKAAAG		RLVTGSQDHT
LRVFRLEDSC		CLFTLQGHSG		AITTVYIDQT		MVLASGGQDG		AICLWDVLTG
SRVSHVFAHR		GDVTSLTCTT		SCVISSGLDD		LISIWDRSTG		IKFYSIQQDL
GCGASLGVIS		DNLLVTGGQG		CVSFWDLNYG		DLLQTVYLGK		NSEAQPARQI
LVLDNAAIVC		NFGSELSLVY		VPSVLEKLD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як метаболізм ліпідів, метаболізм холестеролу, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

• Nakajima T., Hamakubo T., Kodama T., Inazawa J., Emi M. (1999). Genomic structure and chromosomal mapping of the human sterol regulatory element binding protein (SREBP) cleavage-activating protein (SCAP) gene. J. Hum. Genet. 44: 402—407. PMID 10570913 DOI:10.1007/s100380050187
• Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Irisawa M., Inoue J., Ozawa N., Mori K., Sato R. (2009). The sterol-sensing endoplasmic reticulum (ER) membrane protein TRC8 hampers ER to Golgi transport of sterol regulatory element-binding protein-2 (SREBP-2)/SREBP cleavage-activated protein and reduces SREBP-2 cleavage. J. Biol. Chem. 284: 28995—29004. PMID 19706601 DOI:10.1074/jbc.M109.041376
• Iwaki K., Nakajima T., Ota N., Emi M. (1999). A common Ile796Val polymorphism of the human SREBP cleavage-activating protein (SCAP) gene. J. Hum. Genet. 44: 421—422. PMID 10570919 DOI:10.1007/s100380050193

Див. також

• Хромосома 3