SCARB2

SCARB2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4F7B, 4Q4B, 4Q4F, 4TVZ, 4TW0, 4TW2
Ідентифікатори
Символи	SCARB2, AMRF, CD36L2, EPM4, HLGP85, LGP85, LIMP-2, LIMPII, SR-BII, scavenger receptor class B member 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602257 MGI: 1196458 HomoloGene: 48353 GeneCards: SCARB2
Онтологія гена Молекулярна функція • enzyme binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • virus receptor activity • phosphatidylserine binding • transmembrane signaling receptor activity • scavenger receptor activity • phospholipid transporter activity • cholesterol binding • phosphatidylcholine binding • protein homodimerization activity • chaperone binding • cargo receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • лізосома • lysosomal lumen • екзосома • мембрана • focal adhesion • lysosomal membrane • клітинна мембрана • clathrin-coated vesicle membrane • late endosome membrane • Golgi membrane • endoplasmic reticulum membrane • endosome membrane • endocytic vesicle membrane Біологічний процес • viral entry into host cell • protein targeting to lysosome • GO:0022415 viral process • positive regulation of neuron projection development • membrane organization • regulation of endosome organization • regulation of glucosylceramidase activity • regulation of lysosome organization • рецептор-опосередкований ендоцитоз • aminophospholipid transport • regulation of cellular carbohydrate catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	950	12492
Ensembl	ENSG00000138760	ENSMUSG00000029426
UniProt	Q14108	O35114
RefSeq (мРНК)	NM_005506 NM_001204255	NM_007644
RefSeq (білок)	NP_001191184 NP_005497	NP_031670
Локус (UCSC)	Хр. 4: 76.16 – 76.23 Mb	Хр. 5: 92.59 – 92.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCARB2 (англ. Scavenger receptor class B member 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 478 амінокислот, а молекулярна маса — 54 290.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRCCFYTAG		TLSLLLLVTS		VTLLVARVFQ		KAVDQSIEKK		IVLRNGTEAF
DSWEKPPLPV		YTQFYFFNVT		NPEEILRGET		PRVEEVGPYT		YRELRNKANI
QFGDNGTTIS		AVSNKAYVFE		RDQSVGDPKI		DLIRTLNIPV		LTVIEWSQVH
FLREIIEAML		KAYQQKLFVT		HTVDELLWGY		KDEILSLIHV		FRPDISPYFG
LFYEKNGTND		GDYVFLTGED		SYLNFTKIVE		WNGKTSLDWW		ITDKCNMING
TDGDSFHPLI		TKDEVLYVFP		SDFCRSVYIT		FSDYESVQGL		PAFRYKVPAE
ILANTSDNAG		FCIPEGNCLG		SGVLNVSICK		NGAPIIMSFP		HFYQADERFV
SAIEGMHPNQ		EDHETFVDIN		PLTGIILKAA		KRFQINIYVK		KLDDFVETGD
IRTMVFPVMY		LNESVHIDKE		TASRLKSMIN		TTLIITNIPY		IIMALGVFFG
LVFTWLACKG		QGSMDEGTAD		ERAPLIRT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, лізосомі.

Література

• Calvo D., Dopazo J., Vega M.A. (1995). The CD36, CLA-1 (CD36L1), and LIMPII (CD36L2) gene family: cellular distribution, chromosomal location, and genetic evolution. Genomics. 25: 100—106. PMID 7539776 DOI:10.1016/0888-7543(95)80114-2
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827

Див. також

• Хромосома 4