SCRIB

SCRIB
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1UJU, 1WHA, 1X5Q, 2W4F, 4WYU, 4WYT
Ідентифікатори
Символи	SCRIB, CRIB1, SCRB1, SCRIB1, Vartul, scribbled planar cell polarity protein, scribble planar cell polarity protein, oSCRIB
Зовнішні ІД	OMIM: 607733 MGI: 2145950 HomoloGene: 44228 GeneCards: SCRIB
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • guanylate kinase activity; • ionotropic glutamate receptor binding; • cadherin binding;
Клітинна компонента	• postsynaptic membrane; • cell projection; • мембрана; • cell-cell junction; • Адгезивні контакти; • клітинна мембрана; • нуклеоплазма; • myelin sheath abaxonal region; • міжклітинні контакти; • cell leading edge; • presynapse; • екзосома; • presynaptic membrane; • lamellipodium; • Scrib-APC-beta-catenin complex; • цитоплазма; • cell-cell contact zone; • ionotropic glutamate receptor complex; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • basolateral plasma membrane; • синапс; • glutamatergic synapse; • extrinsic component of postsynaptic density membrane;
Біологічний процес	• диференціація клітин; • establishment of apical/basal cell polarity; • synaptic vesicle targeting; • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity; • astrocyte cell migration; • apoptotic process involved in morphogenesis; • Загоєння ран; • auditory receptor cell morphogenesis; • mammary gland duct morphogenesis; • auditory receptor cell stereocilium organization; • multicellular organism development; • neural tube closure; • synaptic vesicle endocytosis; • protein localization to adherens junction; • positive regulation of apoptotic process; • positive chemotaxis; • morphogenesis of embryonic epithelium; • проліферація; • GO:0022415 viral process; • cell migration; • cochlear nucleus development; • negative regulation of mitotic cell cycle; • positive regulation of receptor recycling; • chemical synaptic transmission; • receptor clustering; • establishment or maintenance of epithelial cell apical/basal polarity; • GMP metabolic process; • GDP metabolic process; • receptor localization to synapse; • neurotransmitter receptor transport, endosome to postsynaptic membrane; • neurotransmitter receptor transport postsynaptic membrane to endosome; • suppression by virus of host type I interferon-mediated signaling pathway; • suppression by virus of host innate immune response; • suppression by virus of host JAK-STAT cascade via inhibition of STAT1 activity; • suppression by virus of host JAK-STAT cascade via inhibition of STAT2 activity; • cell-cell adhesion; • GO:0034613 protein localization; • vesicle-mediated transport in synapse; • regulation of postsynaptic neurotransmitter receptor internalization; • post-anal tail morphogenesis; • inner ear receptor cell stereocilium organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	23513
	105782
	ENSG00000274287; ENSG00000180900
	ENSMUSG00000022568
	Q14160
	Q80U72
	NM_182706; NM_015356
	NM_134089; NM_001310542; NM_001310543
	NP_056171; NP_874365
	NP_001297471; NP_001297472; NP_598850
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SCRIB (англ. Scribbled planar cell polarity protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 630 амінокислот, а молекулярна маса — 174 885^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLKCIPLWRC	NRHVESVDKR	HCSLQAVPEE	IYRYSRSLEE	LLLDANQLRE
LPKPFFRLLN	LRKLGLSDNE	IQRLPPEVAN	FMQLVELDVS	RNDIPEIPES
IKFCKALEIA	DFSGNPLSRL	PDGFTQLRSL	AHLALNDVSL	QALPGDVGNL
ANLVTLELRE	NLLKSLPASL	SFLVKLEQLD	LGGNDLEVLP	DTLGALPNLR
ELWLDRNQLS	ALPPELGNLR	RLVCLDVSEN	RLEELPAELG	GLVLLTDLLL
SQNLLRRLPD	GIGQLKQLSI	LKVDQNRLCE	VTEAIGDCEN	LSELILTENL
LMALPRSLGK	LTKLTNLNVD	RNHLEALPPE	IGGCVALSVL	SLRDNRLAVL
PPELAHTTEL	HVLDVAGNRL	QSLPFALTHL	NLKALWLAEN	QAQPMLRFQT
EDDARTGEKV	LTCYLLPQQP	PPSLEDAGQQ	GSLSETWSDA	PPSRVSVIQF
LEAPIGDEDA	EEAAAEKRGL	QRRATPHPSE	LKVMKRSIEG	RRSEACPCQP
DSGSPLPAEE	EKRLSAESGL	SEDSRPSAST	VSEAEPEGPS	AEAQGGSQQE
ATTAGGEEDA	EEDYQEPTVH	FAEDALLPGD	DREIEEGQPE	APWTLPGGRQ
RLIRKDTPHY	KKHFKISKLP	QPEAVVALLQ	GMQPDGEGPV	APGGWHNGPH
APWAPRAQKE	EEEEEEGSPQ	EEEVEEEEEN	RAEEEEASTE	EEDKEGAVVS
APSVKGVSFD	QANNLLIEPA	RIEEEELTLT	ILRQTGGLGI	SIAGGKGSTP
YKGDDEGIFI	SRVSEEGPAA	RAGVRVGDKL	LEVNGVALQG	AEHHEAVEAL
RGAGTAVQMR	VWRERMVEPE	NAVTITPLRP	EDDYSPRERR	GGGLRLPLLP
PESPGPLRQR	HVACLARSER	GLGFSIAGGK	GSTPYRAGDA	GIFVSRIAEG
GAAHRAGTLQ	VGDRVLSING	VDVTEARHDH	AVSLLTAASP	TIALLLEREA
GGPLPPSPLP	HSSPPTAAVA	TTSITTATPG	VPGLPSLAPS	LLAAALEGPY
PVEEIRLPRA	GGPLGLSIVG	GSDHSSHPFG	VQEPGVFISK	VLPRGLAARS
GLRVGDRILA	VNGQDVRDAT	HQEAVSALLR	PCLELSLLVR	RDPAPPGLRE
LCIQKAPGER	LGISIRGGAR	GHAGNPRDPT	DEGIFISKVS	PTGAAGRDGR
LRVGLRLLEV	NQQSLLGLTH	GEAVQLLRSV	GDTLTVLVCD	GFEASTDAAL
EVSPGVIANP	FAAGIGHRNS	LESISSIDRE	LSPEGPGKEK	ELPGQTLHWG
PEATEAAGRG	LQPLKLDYRA	LAAVPSAGSV	QRVPSGAAGG	KMAESPCSPS
GQQPPSPPSP	DELPANVKQA	YRAFAAVPTS	HPPEDAPAQP	PTPGPAASPE
QLSFRERQKY	FELEVRVPQA	EGPPKRVSLV	GADDLRKMQE	EEARKLQQKR
AQMLREAAEA	GAEARLALDG	ETLGEEEQED	EQPPWASPSP	TSRQSPASPP
PLGGGAPVRT	AKAERRHQER	LRVQSPEPPA	PERALSPAEL	RALEAEKRAL
WRAARMKSLE	QDALRAQMVL	SRSQEGRGTR	GPLERLAEAP	SPAPTPSPTP
VEDLGPQTST	SPGRLSPDFA	EELRSLEPSP	SPGPQEEDGE	VALVLLGRPS
PGAVGPEDVA	LCSSRRPVRP	GRRGLGPVPS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nakagawa S., Huibregtse J.M. (2000). Human scribble (Vartul) is targeted for ubiquitin-mediated degradation by the high-risk papillomavirus E6 proteins and the E6AP ubiquitin-protein ligase. Mol. Cell. Biol. 20: 8244—8253. PMID 11027293 DOI:10.1128/MCB.20.21.8244-8253.2000
Metais J.-Y., Navarro C., Santoni M.-J., Audebert S., Borg J.-P. (2005). hScrib interacts with ZO-2 at the cell-cell junctions of epithelial cells. FEBS Lett. 579: 3725—3730. PMID 15975580 DOI:10.1016/j.febslet.2005.05.062
Petit M.M.R., Crombez K.R.M.O., Vervenne H.B.V.K., Weyns N., Van de Ven W.J.M. (2005). The tumor suppressor Scrib selectively interacts with specific members of the zyxin family of proteins. FEBS Lett. 579: 5061—5068. PMID 16137684 DOI:10.1016/j.febslet.2005.08.012
Qin Y., Capaldo C., Gumbiner B.M., Macara I.G. (2005). The mammalian Scribble polarity protein regulates epithelial cell adhesion and migration through E-cadherin. J. Cell Biol. 171: 1061—1071. PMID 16344308 DOI:10.1083/jcb.200506094

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30377 (англ.) . Архів оригіналу за 14 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, Q14160 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:30377 (англ.) . Архів оригіналу за 14 березня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q14160 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

SCRIB

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук