SCX

SCX
Ідентифікатори
Символи	SCX, SCXA, SCXB, bHLHa48, LOC642658, scleraxis bHLH transcription factor
Зовнішні ІД	OMIM: 609067 MGI: 102934 HomoloGene: 85195 GeneCards: SCX
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • bHLH transcription factor binding • E-box binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • transcription regulator complex • клітинне ядро Біологічний процес • cellular response to transforming growth factor beta stimulus • positive regulation of collagen biosynthetic process • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • chondrocyte differentiation • regulation of cartilage development • positive regulation of gastrulation • collagen fibril organization • tendon development • tendon cell differentiation • mesoderm formation • cellular response to BMP stimulus • negative regulation of apoptotic process • Sertoli cell differentiation • endochondral ossification • transcription by RNA polymerase II • BMP signaling pathway • transcription, DNA-templated • sclerotome development • embryonic skeletal system development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • deltoid tuberosity development • cellular response to mechanical stimulus • GO:1901313 positive regulation of gene expression • heart valve formation • positive regulation of cartilage development • heart valve morphogenesis • tissue homeostasis • positive regulation of cell population proliferation • tendon formation • skeletal muscle cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • face morphogenesis • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	642658	20289
Ensembl	ENSG00000260428	ENSMUSG00000034161
UniProt	Q7RTU7	Q64124
RefSeq (мРНК)	NM_001008271 NM_001080514	NM_198885
RefSeq (білок)	NP_001073983	NP_942588
Локус (UCSC)	Хр. 8: 144.27 – 144.27 Mb	Хр. 15: 76.34 – 76.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCX (англ. Scleraxis bHLH transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 201 амінокислот, а молекулярна маса — 21 596.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSFATLRPAP		PGRYLYPEVS		PLSEDEDRGS		DSSGSDEKPC		RVHAARCGLQ
GARRRAGGRR		AGGGGPGGRP		GREPRQRHTA		NARERDRTNS		VNTAFTALRT
LIPTEPADRK		LSKIETLRLA		SSYISHLGNV		LLAGEACGDG		QPCHSGPAFF
HAARAGSPPP		PPPPPPARDG		ENTQPKQICT		FCLSNQRKLS		KDRDRKTAIR
S

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• McLellan A.S., Langlands K., Kealey T. (2002). Exhaustive identification of human class II basic helix-loop-helix proteins by virtual library screening. Gene Expr. Patterns. 2: 329—335. PMID 12617822 DOI:10.1016/S0925-4773(02)00390-8

Див. також

• Хромосома 8