SCYL1

SCYL1
Ідентифікатори
Символи	SCYL1, GKLP, NKTL, NTKL, P105, TAPK, TEIF, TRAP, HT019, SCAR21, SCY1 like pseudokinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607982 MGI: 1931787 HomoloGene: 6947 GeneCards: SCYL1
Пов'язані генетичні захворювання
acute infantile liver failure-cerebellar ataxia-peripheral sensory motor neuropathy syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • protein kinase activity • protein tyrosine kinase activity • ATP binding • cadherin binding Клітинна компонента • центр організації мікротрубочок • cis-Golgi network • комплекс Ґольджі • COPI vesicle coat • цитоскелет • мембрана • клітинне ядро • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • protein phosphorylation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • vesicle-mediated transport • transcription, DNA-templated • peptidyl-tyrosine phosphorylation • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57410	78891
Ensembl	ENSG00000142186	ENSMUSG00000024941
UniProt	Q96KG9	Q9EQC5
RefSeq (мРНК)	NM_001048218 NM_020680	NM_023912 NM_001361921 NM_001361922
RefSeq (білок)	NP_001041683 NP_065731	NP_076401 NP_001348850 NP_001348851
Локус (UCSC)	Хр. 11: 65.53 – 65.54 Mb	Хр. 19: 5.81 – 5.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCYL1 (англ. SCY1 like pseudokinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 808 амінокислот, а молекулярна маса — 89 631.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWFFARDPVR		DFPFELIPEP		PEGGLPGPWA		LHRGRKKATG		SPVSIFVYDV
KPGAEEQTQV		AKAAFKRFKT		LRHPNILAYI		DGLETEKCLH		VVTEAVTPLG
IYLKARVEAG		GLKELEISWG		LHQIVKALSF		LVNDCSLIHN		NVCMAAVFVD
RAGEWKLGGL		DYMYSAQGNG		GGPPRKGIPE		LEQYDPPELA		DSSGRVVREK
WSADMWRLGC		LIWEVFNGPL		PRAAALRNPG		KIPKTLVPHY		CELVGANPKV
RPNPARFLQN		CRAPGGFMSN		RFVETNLFLE		EIQIKEPAEK		QKFFQELSKS
LDAFPEDFCR		HKVLPQLLTA		FEFGNAGAVV		LTPLFKVGKF		LSAEEYQQKI
IPVVVKMFSS		TDRAMRIRLL		QQMEQFIQYL		DEPTVNTQIF		PHVVHGFLDT
NPAIREQTVK		SMLLLAPKLN		EANLNVELMK		HFARLQAKDE		QGPIRCNTTV
CLGKIGSYLS		ASTRHRVLTS		AFSRATRDPF		APSRVAGVLG		FAATHNLYSM
NDCAQKILPV		LCGLTVDPEK		SVRDQAFKAI		RSFLSKLESV		SEDPTQLEEV
EKDVHAASSP		GMGGAAASWA		GWAVTGVSSL		TSKLIRSHPT		TAPTETNIPQ
RPTPEGVPAP		APTPVPATPT		TSGHWETQEE		DKDTAEDSST		ADRWDDEDWG
SLEQEAESVL		AQQDDWSTGG		QVSRASQVSN		SDHKSSKSPE		SDWSSWEAEG
SWEQGWQEPS		SQEPPPDGTR		LASEYNWGGP		ESSDKGDPFA		TLSARPSTQP
RPDSWGEDNW		EGLETDSRQV		KAELARKKRE		ERRREMEAKR		AERKVAKGPM
KLGARKLD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, апараті гольджі.

Література

• Kato M., Yano K., Morotomi-Yano K., Saito H., Miki Y. (2002). Identification and characterization of the human protein kinase-like gene NTKL: mitosis-specific centrosomal localization of an alternatively spliced isoform. Genomics. 79: 760—767. PMID 12036289 DOI:10.1006/geno.2002.6774
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhao Y., Zheng J., Ling Y., Hou L., Zhang B. (2005). Transcriptional upregulation of DNA polymerase beta by TEIF. Biochem. Biophys. Res. Commun. 333: 908—916. PMID 15963946 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.05.172

Див. також

• Хромосома 11