SEC13

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
SEC13
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SEC13, D3S1231E, SEC13L1, SEC13R, npp-20, SEC13 homolog, nuclear pore and COPII coat complex component
Зовнішні ІД OMIM: 600152 MGI: 99832 HomoloGene: 6479 GeneCards: SEC13
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001136026
NM_001136232
NM_001278946
NM_030673
NM_183352
NM_024206
RefSeq (білок)
NP_001129498
NP_001129704
NP_001265875
NP_109598
NP_899195
NP_077168
Локус (UCSC) Хр. 3: 10.29 – 10.32 Mb Хр. 6: 113.71 – 113.72 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SEC13 (англ. SEC13 homolog, nuclear pore and COPII coat complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 322 амінокислот, а молекулярна маса — 35 541[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MVSVINTVDTSHEDMIHDAQMDYYGTRLATCSSDRSVKIFDVRNGGQILI
ADLRGHEGPVWQVAWAHPMYGNILASCSYDRKVIIWREENGTWEKSHEHA
GHDSSVNSVCWAPHDYGLILACGSSDGAISLLTYTGEGQWEVKKINNAHT
IGCNAVSWAPAVVPGSLIDHPSGQKPNYIKRFASGGCDNLIKLWKEEEDG
QWKEEQKLEAHSDWVRDVAWAPSIGLPTSTIASCSQDGRVFIWTCDDASS
NTWSPKLLHKFNDVVWHVSWSITANILAVSGGDNKVTLWKESVDGQWVCI
SDVNKGQGSVSASVTEGQQNEQ

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, комплексі ядерної пори.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Enninga J., Levay A., Fontoura B.M. (2003). Sec13 shuttles between the nucleus and the cytoplasm and stably interacts with Nup96 at the nuclear pore complex. Mol. Cell. Biol. 23: 7271—7284. PMID 14517296 DOI:10.1128/MCB.23.20.7271-7284.2003
  • Stankewich M.C., Stabach P.R., Morrow J.S. (2006). Human Sec31B: a family of new mammalian orthologues of yeast Sec31p that associate with the COPII coat. J. Cell Sci. 119: 958—969. PMID 16495487 DOI:10.1242/jcs.02751
  • Yamasaki A., Tani K., Yamamoto A., Kitamura N., Komada M. (2006). The Ca2+-binding protein ALG-2 is recruited to endoplasmic reticulum exit sites by Sec31A and stabilizes the localization of Sec31A. Mol. Biol. Cell. 17: 4876—4887. PMID 16957052 DOI:10.1091/mbc.E06-05-0444
  • Saxton R.A., Chantranupong L., Knockenhauer K.E., Schwartz T.U., Sabatini D.M. (2016). Mechanism of arginine sensing by CASTOR1 upstream of mTORC1. Nature. 536: 229—233. PMID 27487210 DOI:10.1038/nature19079
  • Hsia K.C., Stavropoulos P., Blobel G., Hoelz A. (2007). Architecture of a coat for the nuclear pore membrane. Cell. 131: 1313—1326. PMID 18160040 DOI:10.1016/j.cell.2007.11.038

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10697 (англ.) . Архів оригіналу за 25 червня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.
  4. UniProt, P55735 (англ.) . Архів оригіналу за 7 липня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]