SEC13

SEC13
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3BG0, 3BG1, 5A9Q
Ідентифікатори
Символи	SEC13, D3S1231E, SEC13L1, SEC13R, npp-20, SEC13 homolog, nuclear pore and COPII coat complex component
Зовнішні ІД	OMIM: 600152 MGI: 99832 HomoloGene: 6479 GeneCards: SEC13
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • structural molecule activity Клітинна компонента • endoplasmic reticulum membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • nuclear envelope • Ядерна пора • нуклеоплазма • GATOR2 complex • nuclear pore outer ring • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • екзосома • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро • кінетохор • Golgi membrane • лізосома • lysosomal membrane • COPII vesicle coat • гіалоплазма • host cell Біологічний процес • mRNA transport • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • COPII vesicle coating • protein transport • intracellular protein transport • vesicle-mediated transport • positive regulation of TOR signaling • sister chromatid cohesion • COPII-coated vesicle cargo loading • GO:0015915 транспорт • protein exit from endoplasmic reticulum • COPII-coated vesicle budding • positive regulation of TORC1 signaling • regulation of glycolytic process • mRNA export from nucleus • tRNA export from nucleus • GO:0022415 viral process • viral transcription • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • GO:0046795 intracellular transport of virus • regulation of cellular response to heat Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6396	110379
Ensembl	ENSG00000157020	ENSMUSG00000030298
UniProt	P55735	Q9D1M0
RefSeq (мРНК)	NM_001136026 NM_001136232 NM_001278946 NM_030673 NM_183352	NM_024206
RefSeq (білок)	NP_001129498 NP_001129704 NP_001265875 NP_109598 NP_899195	NP_077168
Локус (UCSC)	Хр. 3: 10.29 – 10.32 Mb	Хр. 6: 113.71 – 113.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SEC13 (англ. SEC13 homolog, nuclear pore and COPII coat complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 322 амінокислот, а молекулярна маса — 35 541.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVSVINTVDT		SHEDMIHDAQ		MDYYGTRLAT		CSSDRSVKIF		DVRNGGQILI
ADLRGHEGPV		WQVAWAHPMY		GNILASCSYD		RKVIIWREEN		GTWEKSHEHA
GHDSSVNSVC		WAPHDYGLIL		ACGSSDGAIS		LLTYTGEGQW		EVKKINNAHT
IGCNAVSWAP		AVVPGSLIDH		PSGQKPNYIK		RFASGGCDNL		IKLWKEEEDG
QWKEEQKLEA		HSDWVRDVAW		APSIGLPTST		IASCSQDGRV		FIWTCDDASS
NTWSPKLLHK		FNDVVWHVSW		SITANILAVS		GGDNKVTLWK		ESVDGQWVCI
SDVNKGQGSV		SASVTEGQQN		EQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт мРНК, транслокація, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, комплексі ядерної пори.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Enninga J., Levay A., Fontoura B.M. (2003). Sec13 shuttles between the nucleus and the cytoplasm and stably interacts with Nup96 at the nuclear pore complex. Mol. Cell. Biol. 23: 7271—7284. PMID 14517296 DOI:10.1128/MCB.23.20.7271-7284.2003
• Stankewich M.C., Stabach P.R., Morrow J.S. (2006). Human Sec31B: a family of new mammalian orthologues of yeast Sec31p that associate with the COPII coat. J. Cell Sci. 119: 958—969. PMID 16495487 DOI:10.1242/jcs.02751
• Yamasaki A., Tani K., Yamamoto A., Kitamura N., Komada M. (2006). The Ca2+-binding protein ALG-2 is recruited to endoplasmic reticulum exit sites by Sec31A and stabilizes the localization of Sec31A. Mol. Biol. Cell. 17: 4876—4887. PMID 16957052 DOI:10.1091/mbc.E06-05-0444
• Saxton R.A., Chantranupong L., Knockenhauer K.E., Schwartz T.U., Sabatini D.M. (2016). Mechanism of arginine sensing by CASTOR1 upstream of mTORC1. Nature. 536: 229—233. PMID 27487210 DOI:10.1038/nature19079
• Hsia K.C., Stavropoulos P., Blobel G., Hoelz A. (2007). Architecture of a coat for the nuclear pore membrane. Cell. 131: 1313—1326. PMID 18160040 DOI:10.1016/j.cell.2007.11.038

Див. також

• Хромосома 3