SF3A2

SF3A2
Ідентифікатори
Символи	SF3A2, PRP11, PRPF11, SAP62, SF3a66, splicing factor 3a subunit 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600796 MGI: 104912 HomoloGene: 136815 GeneCards: SF3A2
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • RNA binding Клітинна компонента • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • small nuclear ribonucleoprotein complex • U2-type prespliceosome • клітинне ядро • U2 snRNP • нуклеоплазма • U2-type precatalytic spliceosome Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • mRNA 3'-splice site recognition • Сплайсинг РНК • positive regulation of neuron projection development • spliceosomal complex assembly • U2-type prespliceosome assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8175	20222
Ensembl	ENSG00000104897	ENSMUSG00000020211
UniProt	Q15428	Q62203
RefSeq (мРНК)	NM_007165	NM_013651
RefSeq (білок)	NP_009096	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 19: 2.24 – 2.25 Mb	Хр. 10: 80.63 – 80.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SF3A2 (англ. Splicing factor 3a subunit 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 464 амінокислот, а молекулярна маса — 49 256.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDFQHRPGGK		TGSGGVASSS		ESNRDRRERL		RQLALETIDI		NKDPYFMKNH
LGSYECKLCL		TLHNNEGSYL		AHTQGKKHQT		NLARRAAKEA		KEAPAQPAPE
KVKVEVKKFV		KIGRPGYKVT		KQRDSEMGQQ		SLLFQIDYPE		IAEGIMPRHR
FMSAYEQRIE		PPDRRWQYLL		MAAEPYETIA		FKVPSREIDK		AEGKFWTHWN
RETKQFFLQF		HFKMEKPPAP		PSLPAGPPGV		KRPPPPLMNG		LPPRPPLPES
LPPPPPGGLP		LPPMPPTGPA		PSGPPGPPQL		PPPAPGVHPP		APVVHPPASG
VHPPAPGVHP		PAPGVHPPAP		GVHPPTSGVH		PPAPGVHPPA		PGVHPPAPGV
HPPAPGVHPP		APGVHPPPSA		GVHPQAPGVH		PAAPAVHPQA		PGVHPPAPGM
HPQAPGVHPQ		PPGVHPSAPG		VHPQPPGVHP		SNPGVHPPTP		MPPMLRPPLP
SEGPGNIPPP		PPTN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• Bennett M., Reed R. (1993). Correspondence between a mammalian spliceosome component and an essential yeast splicing factor. Science. 262: 105—108. PMID 8211113 DOI:10.1126/science.8211113
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Das R., Zhou Z., Reed R. (2000). Functional association of U2 snRNP with the ATP-independent spliceosomal complex E. Mol. Cell. 5: 779—787. PMID 10882114 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80318-4
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088

Див. також

• Хромосома 19