SFMBT1

SFMBT1
Ідентифікатори
Символи	SFMBT1, RU1, SFMBT, hSFMBT, Scm-like with four mbt domains 1, Scm like with four mbt domains 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607319 MGI: 1859609 HomoloGene: 9472 GeneCards: SFMBT1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0031493 histone binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • negative regulation of muscle organ development • диференціація клітин • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Сперматогенез • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51460	54650
Ensembl	ENSG00000163935	ENSMUSG00000006527
UniProt	Q9UHJ3	Q9JMD1
RefSeq (мРНК)	NM_001005158 NM_001005159 NM_016329	NM_001166531 NM_001166532 NM_019460 NM_175254
RefSeq (білок)	NP_057413	NP_001160003 NP_001160004 NP_062333
Локус (UCSC)	Хр. 3: 52.9 – 53.05 Mb	Хр. 14: 30.44 – 30.54 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SFMBT1 (англ. Scm like with four mbt domains 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 866 амінокислот, а молекулярна маса — 98 141.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNGEQQLDAD		AGSGMEEVEL		SWEDYLEETG		STAVPYGSFK		HVDTRLQNGF
APGMKLEVAV		RTDPETYWVA		TVITTCEQLL		LLRYDGYGED		RRADFWCDIR
KADLYPIGWC		EQNKKTLEAP		EGIRDKVSDW		DEFLRQTLIG		ACSPPVPLLE
GLRNGRNPLD		LIAPGSRLEC		QAFQDSLSTW		IVTVVENIGG		RLKLRYEGLE
SSDNYEHWLY		YLDPFLHHVG		WAAQQGYELQ		PPSAIRHLKN		EAEWQEILAK
VKEEEEEPLP		SYLFKDKQVI		GIHTFSVNMK		LEAVDPWSPF		GISPATVVKV
FDEKYFLVEM		DDLRPENHAR		RSFVCHADSP		GIFPVQWSLK		NGLHISPPPG
YPSQDFDWAD		YLKQCGAEAA		PQRCFPPLIS		EHEFKENMKL		EAVNPILPEE
VCVATITAVR		GSYLWLQLEG		SKKPIPECIV		SVESMDIFPL		GWCETNGHPL
STPRRARVYK		QRKIAVVQPE		KQVPSSRTVH		EGLRNQELNS		TESVMINGKY
CCPKIYFNHR		CFSGPYLNKG		RIAELPQCVG		PGNCVLVLRE		VLTLLINAAY
KPSRVLRELQ		LDKDSVWHGC		GEVLKAKYKG		KSYRATVEIV		KTADRVTEFC
RQTCIKLECC		PNLFGPRMVL		DKCSENCSVL		TKTKYTHYYG		KKKNKRIGRP
PGGHSNLACA		LKKASKRRKR		RKNVFVHKKK		RSSASVDNTP		AGSPQGSGGE
DEDDPDEGDD		DSLSEGSTSE		QQDELQEESE		MSEKKSCSSS		PTQSEISTSL
PPDRQRRKRE		LRTFSFSDDE		NKPPSPKEIR		IEVAERLHLD		SNPLKWSVAD
VVRFIRSTDC		APLARIFLDQ		EIDGQALLLL		TLPTVQECMD		LKLGPAIKLC
HHIERIKFAF		YEQFAN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація, сперматогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wu S., Trievel R.C., Rice J.C. (2007). Human SFMBT is a transcriptional repressor protein that selectively binds the N-terminal tail of histone H3. FEBS Lett. 581: 3289—3296. PMID 17599839 DOI:10.1016/j.febslet.2007.06.025

Див. також

• Хромосома 3