SIN3A

SIN3A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1PO4
Ідентифікатори
Символи	SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, SIN3 transcription regulator family member A, WITKOS
Зовнішні ІД	OMIM: 607776 MGI: 107157 HomoloGene: 32124 GeneCards: SIN3A
Пов'язані генетичні захворювання
chromosome 15q24 deletion syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • histone deacetylase activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein deacetylase activity • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • transcription regulator complex • transcription repressor complex • нуклеоплазма • ядерце • Хроматин • клітинне ядро • кінетохор • Sin3 complex • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • negative regulation of protein localization to nucleus • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress • ритмічний процес • cellular response to dopamine • response to methylglyoxal • negative regulation of circadian rhythm • regulation of hormone levels • GO:0010260 старіння людини • negative regulation of apoptotic process • in utero embryonic development • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • protein deacetylation • реплікація ДНК • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • response to organonitrogen compound • hematopoietic progenitor cell differentiation • activation of innate immune response • positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone deacetylation • negative regulation of histone H3-K27 acetylation • cellular response to glucose stimulus • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of defense response to virus by host • regulation of lipid metabolic process • regulation of megakaryocyte differentiation • negative regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25942	20466
Ensembl	ENSG00000169375	ENSMUSG00000042557
UniProt	Q96ST3	Q60520
RefSeq (мРНК)	NM_001145357 NM_001145358 NM_015477	NM_001110350 NM_001110351 NM_011378 NM_001357754
RefSeq (білок)	NP_001138829 NP_001138830 NP_056292	NP_001103820 NP_001103821 NP_035508 NP_001344683
Локус (UCSC)	Хр. 15: 75.37 – 75.46 Mb	Хр. 9: 56.98 – 57.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SIN3A (англ. SIN3 transcription regulator family member A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 273 амінокислот, а молекулярна маса — 145 175.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKRRLDDQES		PVYAAQQRRI		PGSTEAFPHQ		HRVLAPAPPV		YEAVSETMQS
ATGIQYSVTP		SYQVSAMPQS		SGSHGPAIAA		VHSSHHHPTA		VQPHGGQVVQ
SHAHPAPPVA		PVQGQQQFQR		LKVEDALSYL		DQVKLQFGSQ		PQVYNDFLDI
MKEFKSQSID		TPGVISRVSQ		LFKGHPDLIM		GFNTFLPPGY		KIEVQTNDMV
NVTTPGQVHQ		IPTHGIQPQP		QPPPQHPSQP		SAQSAPAPAQ		PAPQPPPAKV
SKPSQLQAHT		PASQQTPPLP		PYASPRSPPV		QPHTPVTISL		GTAPSLQNNQ
PVEFNHAINY		VNKIKNRFQG		QPDIYKAFLE		ILHTYQKEQR		NAKEAGGNYT
PALTEQEVYA		QVARLFKNQE		DLLSEFGQFL		PDANSSVLLS		KTTAEKVDSV
RNDHGGTVKK		PQLNNKPQRP		SQNGCQIRRH		PTGTTPPVKK		KPKLLNLKDS
SMADASKHGG		GTESLFFDKV		RKALRSAEAY		ENFLRCLVIF		NQEVISRAEL
VQLVSPFLGK		FPELFNWFKN		FLGYKESVHL		ETYPKERATE		GIAMEIDYAS
CKRLGSSYRA		LPKSYQQPKC		TGRTPLCKEV		LNDTWVSFPS		WSEDSTFVSS
KKTQYEEHIY		RCEDERFELD		VVLETNLATI		RVLEAIQKKL		SRLSAEEQAK
FRLDNTLGGT		SEVIHRKALQ		RIYADKAADI		IDGLRKNPSI		AVPIVLKRLK
MKEEEWREAQ		RGFNKVWREQ		NEKYYLKSLD		HQGINFKQND		TKVLRSKSLL
NEIESIYDER		QEQATEENAG		VPVGPHLSLA		YEDKQILEDA		AALIIHHVKR
QTGIQKEDKY		KIKQIMHHFI		PDLLFAQRGD		LSDVEEEEEE		EMDVDEATGA
VKKHNGVGGS		PPKSKLLFSN		TAAQKLRGMD		EVYNLFYVNN		NWYIFMRLHQ
ILCLRLLRIC		SQAERQIEEE		NREREWEREV		LGIKRDKSDS		PAIQLRLKEP
MDVDVEDYYP		AFLDMVRSLL		DGNIDSSQYE		DSLREMFTIH		AYIAFTMDKL
IQSIVRQLQH		IVSDEICVQV		TDLYLAENNN		GATGGQLNTQ		NSRSLLESTY
QRKAEQLMSD		ENCFKLMFIQ		SQGQVQLTIE		LLDTEEENSD		DPVEAERWSD
YVERYMNSDT		TSPELREHLA		QKPVFLPRNL		RRIRKCQRGR		EQQEKEGKEG
NSKKTMENVD		SLDKLECRFK		LNSYKMVYVI		KSEDYMYRRT		ALLRAHQSHE
RVSKRLHQRF		QAWVDKWTKE		HVPREMAAET		SKWLMGEGLE		GLVPCTTTCD
TETLHFVSIN		KYRVKYGTVF		KAP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, ацетилювання. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mathur M., Tucker P.W., Samuels H.H. (2001). PSF is a novel corepressor that mediates its effect through Sin3A and the DNA binding domain of nuclear hormone receptors. Mol. Cell. Biol. 21: 2298—2311. PMID 11259580 DOI:10.1128/MCB.21.7.2298-2311.2001
• Yang X., Zhang F., Kudlow J.E. (2002). Recruitment of O-GlcNAc transferase to promoters by corepressor mSin3A: coupling protein O-GlcNAcylation to transcriptional repression. Cell. 110: 69—80. PMID 12150998 DOI:10.1016/S0092-8674(02)00810-3
• Wysocka J., Myers M.P., Laherty C.D., Eisenman R.N., Herr W. (2003). Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1. Genes Dev. 17: 896—911. PMID 12670868 DOI:10.1101/gad.252103
• Fleischer T.C., Yun U.J., Ayer D.E. (2003). Identification and characterization of three new components of the mSin3A corepressor complex. Mol. Cell. Biol. 23: 3456—3467. PMID 12724404 DOI:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003
• Nikolaev A.Y., Papanikolaou N.A., Li M., Qin J., Gu W. (2004). Identification of a novel BRMS1-homologue protein p40 as a component of the mSin3A/p33(ING1b)/HDAC1 deacetylase complex. Biochem. Biophys. Res. Commun. 323: 1216—1222. PMID 15451426 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.08.227

Див. також

• Хромосома 15