SLC2A4RG

SLC2A4RG
Ідентифікатори
Символи	SLC2A4RG, GEF, HDBP-1, HDBP1, Si-1-2, Si-1-2-19, SLC2A4 regulator
Зовнішні ІД	OMIM: 609493 HomoloGene: 88865 GeneCards: SLC2A4RG
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear speck • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56731	н/д
Ensembl	ENSG00000125520	н/д
UniProt	Q9NR83	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_020062	н/д
RefSeq (білок)	NP_064446	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 20: 63.74 – 63.74 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

SLC2A4RG (англ. SLC2A4 regulator) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 387 амінокислот, а молекулярна маса — 41 267.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERPPPRAAG		RDPSALRAEA		PWLRAEGPGP		RAAPVTVPTP		PQGSSVGGGF
AGLEFARPQE		SEPRASDLGA		PRTWTGAAAG		PRTPSAHIPV		PAQRATPGKA
RLDEVMAAAA		LTSLSTSPLL		LGAPVAAFSP		EPGLEPWKEA		LVRPPGSYSS
SSNSGDWGWD		LASDQSSPST		PSPPLPPEAA		HFLFGEPTLR		KRKSPAQVMF
QCLWKSCGKV		LSTASAMQRH		IRLVHLGRQA		EPEQSDGEED		FYYTELDVGV
DTLTDGLSSL		TPVSPTASMP		PAFPRLELPE		LLEPPALPSP		LRPPAPPLPP
PPVLSTVANP		QSCHSDRVYQ		GCLTPARLEP		QPTEVGACPP		ALSSRIGVTL
RKPRGDAKKC		RKVYGMERRD		LWCTACRWKK		ACQRFLD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Oshel K.M., Knight J.B., Cao K.T., Thai M.V., Olson A.L. (2000). Identification of a 30-base pair regulatory element and novel DNA binding protein that regulates the human GLUT4 promoter in transgenic mice. J. Biol. Chem. 275: 23666—23673. PMID 10825161 DOI:10.1074/jbc.M001452200
• Tanaka K., Shouguchi-Miyata J., Miyamoto N., Ikeda J.-E. (2004). Novel nuclear shuttle proteins, HDBP1 and HDBP2, bind to neuronal cell-specific cis-regulatory element in the promoter for the human Huntington's disease gene. J. Biol. Chem. 279: 7275—7286. PMID 14625278 DOI:10.1074/jbc.M310726200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Knight J.B., Eyster C.A., Griesel B.A., Olson A.L. (2003). Regulation of the human GLUT4 gene promoter: interaction between a transcriptional activator and myocyte enhancer factor 2A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 14725—14730. PMID 14630949 DOI:10.1073/pnas.2432756100

Див. також

• Хромосома 20