SLU7

SLU7
Ідентифікатори
Символи	SLU7, 9G8, hSlu7, SLU7 homolog, splicing factor
Зовнішні ІД	OMIM: 605974 MGI: 2385598 HomoloGene: 4690 GeneCards: SLU7
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • pre-mRNA 3'-splice site binding • second spliceosomal transesterification activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • zinc ion binding Клітинна компонента • цитоплазма • nuclear speck • catalytic step 2 spliceosome • мембрана • внутрішньоклітинна мембранна органела • small nuclear ribonucleoprotein complex • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • cellular response to heat • RNA splicing, via transesterification reactions • mRNA processing • mRNA 3'-splice site recognition • Сплайсинг РНК • intracellular protein transport • Альтернативний сплайсинг • RNA export from nucleus • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA export from nucleus • mRNA 3'-end processing • termination of RNA polymerase II transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10569	193116
Ensembl	ENSG00000164609	ENSMUSG00000020409
UniProt	O95391	Q8BHJ9
RefSeq (мРНК)	NM_006425	NM_148673 NM_198936
RefSeq (білок)	NP_006416 NP_001351446 NP_001351447 NP_001351449 NP_001351450 NP_001351451 NP_001351452	NP_683514 NP_945174
Локус (UCSC)	Хр. 5: 160.4 – 160.42 Mb	Хр. 11: 43.32 – 43.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLU7 (англ. SLU7 homolog, splicing factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 586 амінокислот, а молекулярна маса — 68 387.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSATVVDAVN		AAPLSGSKEM		SLEEPKKMTR		EDWRKKKELE		EQRKLGNAPA
EVDEEGKDIN		PHIPQYISSV		PWYIDPSKRP		TLKHQRPQPE		KQKQFSSSGE
WYKRGVKENS		IITKYRKGAC		ENCGAMTHKK		KDCFERPRRV		GAKFTGTNIA
PDEHVQPQLM		FDYDGKRDRW		NGYNPEEHMK		IVEEYAKVDL		AKRTLKAQKL
QEELASGKLV		EQANSPKHQW		GEEEPNSQME		KDHNSEDEDE		DKYADDIDMP
GQNFDSKRRI		TVRNLRIRED		IAKYLRNLDP		NSAYYDPKTR		AMRENPYANA
GKNPDEVSYA		GDNFVRYTGD		TISMAQTQLF		AWEAYDKGSE		VHLQADPTKL
ELLYKSFKVK		KEDFKEQQKE		SILEKYGGQE		HLDAPPAELL		LAQTEDYVEY
SRHGTVIKGQ		ERAVACSKYE		EDVKIHNHTH		IWGSYWKEGR		WGYKCCHSFF
KYSYCTGEAG		KEIVNSEECI		INEITGEESV		KKPQTLMELH		QEKLKEEKKK
KKKKKKKHRK		SSSDSDDEEK		KHEKLKKALN		AEEARLLHVK		ETMQIDERKR
PYNSMYETRE		PTEEEMEAYR		MKRQRPDDPM		ASFLGQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Chua K., Reed R. (1999). Human step II splicing factor hSlu7 functions in restructuring the spliceosome between the catalytic steps of splicing. Genes Dev. 13: 841—850. PMID 10197984 DOI:10.1101/gad.13.7.841
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chua K., Reed R. (1999). The RNA splicing factor hSlu7 is required for correct 3' splice-site choice. Nature. 402: 207—210. PMID 10647016 DOI:10.1038/46086
• Lev-Maor G., Sorek R., Shomron N., Ast G. (2003). The birth of an alternatively spliced exon: 3' splice-site selection in Alu exons. Science. 300: 1288—1291. PMID 12764196 DOI:10.1126/science.1082588
• Shomron N., Reznik M., Ast G. (2004). Splicing factor hSlu7 contains a unique functional domain required to retain the protein within the nucleus. Mol. Biol. Cell. 15: 3782—3795. PMID 15181151 DOI:10.1091/mbc.E04-02-0152
• Shomron N., Alberstein M., Reznik M., Ast G. (2005). Stress alters the subcellular distribution of hSlu7 and thus modulates alternative splicing. J. Cell Sci. 118: 1151—1159. PMID 15728250 DOI:10.1242/jcs.01720

Див. також

• Хромосома 5