SLX1B

SLX1B
Ідентифікатори
Символи	SLX1B, GIYD2, Slx1 structure-specific endonuclease subunit homolog b, SLX1 homolog B, structure-specific endonuclease subunit
Зовнішні ІД	OMIM: 615823 MGI: 1915220 HomoloGene: 11434 GeneCards: SLX1B
Онтологія гена Молекулярна функція • nuclease activity • endonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • 5'-flap endonuclease activity • endodeoxyribonuclease activity • crossover junction endodeoxyribonuclease activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • Slx1-Slx4 complex Біологічний процес • DNA double-strand break processing involved in repair via single-strand annealing • cellular response to DNA damage stimulus • DNA recombination • interstrand cross-link repair • positive regulation of t-circle formation • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • GO:0100026 Репарація ДНК • double-strand break repair via homologous recombination • telomere maintenance via telomere lengthening • t-circle formation • negative regulation of telomere maintenance via telomere lengthening • telomeric D-loop disassembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79008	75764
Ensembl	ENSG00000181625	ENSMUSG00000059772
UniProt	Q9BQ83	Q8BX32
RefSeq (мРНК)	NM_178044 NM_024044 NM_001400286 NM_001400287	NM_029420
RefSeq (білок)	NP_001014999 NP_001015000	NP_083696
Локус (UCSC)	Хр. 16: 29.45 – 29.46 Mb	Хр. 7: 126.29 – 126.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLX1B (англ. SLX1 homolog B, structure-specific endonuclease subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 275 амінокислот, а молекулярна маса — 30 771.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGPAGVAARP		GRFFGVYLLY		CLNPRYRGRV		YVGFTVNTAR		RVQQHNGGRK
KGGAWRTSGR		GPWEMVLVVH		GFPSSVAALR		FEWAWQHPHA		SRRLAHVGPR
LRGETAFAFH		LRVLAHMLRA		PPWARLPLTL		RWVRPDLRQD		LCLPPPPHVP
LAFGPPPPQA		PAPRRRAGPF		DDAEPEPDQG		DPGACCSLCA		QTIQDEEGPL
CCPHPGCLLR		AHVICLAEEF		LQEEPGQLLP		LEGQCPCCEK		SLLWGDLIWL
CQMDTEKEVE		DSELEEAHWT		DLLET

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, нуклеаз, ендонуклеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16