SMARCD3

SMARCD3
Ідентифікатори
Символи	SMARCD3, BAF60C, CRACD3, Rsc6p, SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3
Зовнішні ІД	OMIM: 601737 MGI: 1914243 HomoloGene: 2314 GeneCards: SMARCD3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear receptor binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor binding Клітинна компонента • цитоплазма • nBAF complex • Нуклеоплазма • npBAF complex • клітинне ядро • SWI/SNF complex Біологічний процес • positive regulation of neuroblast proliferation • Ремоделювання хроматину • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cardiac right ventricle formation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • heart morphogenesis • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • muscle cell differentiation • nucleosome disassembly • positive regulation of smooth muscle cell differentiation • positive regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • secondary heart field specification • regulation of protein binding • neural retina development • regulation of lipid metabolic process • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • positive regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6604	66993
Ensembl	ENSG00000082014	ENSMUSG00000028949
UniProt	Q6STE5	Q6P9Z1
RefSeq (мРНК)	NM_001003801 NM_001003802 NM_003078	NM_025891
RefSeq (білок)	NP_001003801 NP_001003802 NP_003069	NP_080167
Локус (UCSC)	Хр. 7: 151.24 – 151.28 Mb	Хр. 5: 24.8 – 24.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMARCD3 (англ. SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 483 амінокислот, а молекулярна маса — 55 016.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAADEVAGGA		RKATKSKLFE		FLVHGVRPGM		PSGARMPHQG		APMGPPGSPY
MGSPAVRPGL		APAGMEPARK		RAAPPPGQSQ		AQSQGQPVPT		APARSRSAKR
RKMADKILPQ		RIRELVPESQ		AYMDLLAFER		KLDQTIMRKR		VDIQEALKRP
MKQKRKLRLY		ISNTFNPAKP		DAEDSDGSIA		SWELRVEGKL		LDDPSKQKRK
FSSFFKSLVI		ELDKDLYGPD		NHLVEWHRTP		TTQETDGFQV		KRPGDLSVRC
TLLLMLDYQP		PQFKLDPRLA		RLLGLHTQSR		SAIVQALWQY		VKTNRLQDSH
DKEYINGDKY		FQQIFDCPRL		KFSEIPQRLT		ALLLPPDPIV		INHVISVDPS
DQKKTACYDI		DVEVEEPLKG		QMSSFLLSTA		NQQEISALDS		KIHETIESIN
QLKIQRDFML		SFSRDPKGYV		QDLLRSQSRD		LKVMTDVAGN		PEEERRAEFY
HQPWSQEAVS		RYFYCKIQQR		RQELEQSLVV		RNT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, нейрогенез, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7