SMOC1

SMOC1
Ідентифікатори
Символи	SMOC1, OAS, SPARC related modular calcium binding 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608488 MGI: 1929878 HomoloGene: 56943 GeneCards: SMOC1
Пов'язані генетичні захворювання
	microphthalmia with limb anomalies
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв'язування з іоном металу; • extracellular matrix binding;
Клітинна компонента	• extracellular region; • базальна мембрана;
Біологічний процес	• розвиток ока; • multicellular organism development; • диференціація клітин; • regulation of osteoblast differentiation; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • limb development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	64093
	64075
	ENSG00000198732
	ENSMUSG00000021136
	Q9H4F8
	Q8BLY1
	NM_001034852; NM_022137
	NM_001146217; NM_022316
	NP_001030024; NP_071420
	NP_001139689; NP_071711
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SMOC1 (англ. SPARC related modular calcium binding 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 434 амінокислот, а молекулярна маса — 48 163^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLPARCARLL	TPHLLLVLVQ	LSPARGHRTT	GPRFLISDRD	PQCNLHCSRT
QPKPICASDG	RSYESMCEYQ	RAKCRDPTLG	VVHRGRCKDA	GQSKCRLERA
QALEQAKKPQ	EAVFVPECGE	DGSFTQVQCH	TYTGYCWCVT	PDGKPISGSS
VQNKTPVCSG	SVTDKPLSQG	NSGRKDDGSK	PTPTMETQPV	FDGDEITAPT
LWIKHLVIKD	SKLNNTNIRN	SEKVYSCDQE	RQSALEEAQQ	NPREGIVIPE
CAPGGLYKPV	QCHQSTGYCW	CVLVDTGRPL	PGTSTRYVMP	SCESDARAKT
TEADDPFKDR	ELPGCPEGKK	MEFITSLLDA	LTTDMVQAIN	SAAPTGGGRF
SEPDPSHTLE	ERVVHWYFSQ	LDSNSSNDIN	KREMKPFKRY	VKKKAKPKKC
ARRFTDYCDL	NKDKVISLPE	LKGCLGVSKE	GRLV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література[ред. | ред. код]

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Aldahmesh M.A., Khan A.O., Hijazi H., Alkuraya F.S. (2013). Mutations in ALDH1A3 cause Microphthalmia. Clin. Genet. 84: 128—131. PMID 23646827 DOI:10.1111/cge.12184

Примітки[ред. | ред. код]

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SMOC1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20318 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 20 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9H4F8 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 20 вересня 2017.

Див. також[ред. | ред. код]

Хромосома 14

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з SMOC1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20318 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 20 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q9H4F8 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 20 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

SMOC1

Література[ред. | ред. код]

Примітки[ред. | ред. код]

Див. також[ред. | ред. код]

Навігаційне меню

Пошук