SMOC2

SMOC2
Ідентифікатори
Символи	SMOC2, DTDP1, MST117, MSTP117, MSTP140, SMAP2, bA270C4A.1, bA37D8.1, dJ421D16.1, SPARC related modular calcium binding 2
Зовнішні ІД	OMIM: 607223 MGI: 1929881 HomoloGene: 11150 GeneCards: SMOC2
Пов'язані генетичні захворювання
вітиліго
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • glycosaminoglycan binding • heparin binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • extracellular region • базальна мембрана • interstitial matrix • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix • cell periphery • GO:0005578 Позаклітинна матриця Біологічний процес • extracellular matrix organization • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of cell-substrate adhesion • positive regulation of endothelial cell migration • positive regulation of vascular wound healing • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of mitotic cell cycle • positive regulation of vascular endothelial growth factor signaling pathway • positive regulation of DNA biosynthetic process • positive regulation of endothelial cell chemotaxis • positive regulation of fibroblast growth factor receptor signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64094	64074
Ensembl	ENSG00000112562	ENSMUSG00000023886
UniProt	Q9H3U7	Q8CD91
RefSeq (мРНК)	NM_001166412 NM_022138	NM_022315
RefSeq (білок)	NP_001159884 NP_071421	NP_071710
Локус (UCSC)	Хр. 6: 168.44 – 168.67 Mb	Хр. 17: 14.5 – 14.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMOC2 (англ. SPARC related modular calcium binding 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 446 амінокислот, а молекулярна маса — 49 674.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLPQLCWLP		LLAGLLPPVP		AQKFSALTFL		RVDQDKDKDC		SLDCAGSPQK
PLCASDGRTF		LSRCEFQRAK		CKDPQLEIAY		RGNCKDVSRC		VAERKYTQEQ
ARKEFQQVFI		PECNDDGTYS		QVQCHSYTGY		CWCVTPNGRP		ISGTAVAHKT
PRCPGSVNEK		LPQREGTGKT		DDAAAPALET		QPQGDEEDIA		SRYPTLWTEQ
VKSRQNKTNK		NSVSSCDQEH		QSALEEAKQP		KNDNVVIPEC		AHGGLYKPVQ
CHPSTGYCWC		VLVDTGRPIP		GTSTRYEQPK		CDNTARAHPA		KARDLYKGRQ
LQGCPGAKKH		EFLTSVLDAL		STDMVHAASD		PSSSSGRLSE		PDPSHTLEER
VVHWYFKLLD		KNSSGDIGKK		EIKPFKRFLR		KKSKPKKCVK		KFVEYCDVNN
DKSISVQELM		GCLGVAKEDG		KADTKKRHTP		RGHAESTSNR		QPRKQG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Vannahme C., Goesling S., Paulsson M., Maurer P., Hartmann U. (2003). Characterization of SMOC-2, a modular extracellular calcium-binding protein. Biochem. J. 373: 805—814. PMID 12741954 DOI:10.1042/BJ20030532
• Rocnik E.F., Liu P., Sato K., Walsh K., Vaziri C. (2006). The novel SPARC family member SMOC-2 potentiates angiogenic growth factor activity. J. Biol. Chem. 281: 22855—22864. PMID 16774925 DOI:10.1074/jbc.M513463200

Див. також

• Хромосома 6