SNAI2

SNAI2
Ідентифікатори
Символи	SNAI2, SLUG, SLUGH1, SNAIL2, WS2D, snail family transcriptional repressor 2, SLUGH
Зовнішні ІД	OMIM: 602150 MGI: 1096393 HomoloGene: 31127 GeneCards: SNAI2
Пов'язані генетичні захворювання
Waardenburg syndrome type 2D, piebaldism
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • E-box binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • negative regulation of vitamin D receptor signaling pathway • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • neural crest cell development • negative regulation of keratinocyte proliferation • regulation of bicellular tight junction assembly • positive regulation of cell migration • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • transcription, DNA-templated • cellular response to epidermal growth factor stimulus • negative regulation of vitamin D biosynthetic process • regulation of chemokine production • multicellular organism development • negative regulation of chondrocyte differentiation • negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • regulation of osteoblast differentiation • osteoblast differentiation • canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of cell adhesion mediated by integrin • negative regulation of anoikis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Епітеліально-мезенхімальний перехід • epithelial to mesenchymal transition involved in endocardial cushion formation • cell migration involved in endocardial cushion formation • sensory perception of sound • desmosome disassembly • pigmentation • epithelium development • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • aortic valve morphogenesis • negative regulation of cell adhesion involved in substrate-bound cell migration • response to radiation • cell migration • positive regulation of histone acetylation • negative regulation of apoptotic process • positive regulation of fat cell differentiation • white fat cell differentiation • roof of mouth development • cartilage morphogenesis • regulation of branching involved in salivary gland morphogenesis • cellular response to ionizing radiation • negative regulation of stem cell proliferation • Notch signaling involved in heart development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6591	20583
Ensembl	ENSG00000019549	ENSMUSG00000022676
UniProt	O43623	P97469
RefSeq (мРНК)	NM_003068	NM_011415
RefSeq (білок)	NP_003059	NP_035545
Локус (UCSC)	Хр. 8: 48.92 – 48.92 Mb	Хр. 16: 14.52 – 14.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNAI2 (англ. Snail family transcriptional repressor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 268 амінокислот, а молекулярна маса — 29 986.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRSFLVKKH		FNASKKPNYS		ELDTHTVIIS		PYLYESYSMP		VIPQPEILSS
GAYSPITVWT		TAAPFHAQLP		NGLSPLSGYS		SSLGRVSPPP		PSDTSSKDHS
GSESPISDEE		ERLQSKLSDP		HAIEAEKFQC		NLCNKTYSTF		SGLAKHKQLH
CDAQSRKSFS		CKYCDKEYVS		LGALKMHIRT		HTLPCVCKIC		GKAFSRPWLL
QGHIRTHTGE		KPFSCPHCNR		AFADRSNLRA		HLQTHSDVKK		YQCKNCSKTF
SRMSLLHKHE		ESGCCVAH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Hemavathy K., Guru S.C., Harris J., Chen J.D., Ip Y.T. (2000). Human Slug is a repressor that localizes to sites of active transcription. Mol. Cell. Biol. 20: 5087—5095. PMID 10866665 DOI:10.1128/MCB.20.14.5087-5095.2000
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mingot J.M., Vega S., Maestro B., Sanz J.M., Nieto M.A. (2009). Characterization of Snail nuclear import pathways as representatives of C2H2 zinc finger transcription factors. J. Cell Sci. 122: 1452—1460. PMID 19386897 DOI:10.1242/jcs.041749
• Hajra K.M., Chen D.Y., Fearon E.R. (2002). The SLUG zinc-finger protein represses E-cadherin in breast cancer. Cancer Res. 62: 1613—1618. PMID 11912130

Див. також

• Хромосома 8