SNAPC1

SNAPC1
Ідентифікатори
Символи	SNAPC1, PTFgamma, SNAP43, small nuclear RNA activating complex polypeptide 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600591 MGI: 1922877 HomoloGene: 2317 GeneCards: SNAPC1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • snRNA-activating protein complex • клітинне ядро • Нуклеоплазма • ядерце Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase III • snRNA transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6617	75627
Ensembl	ENSG00000023608	ENSMUSG00000021113
UniProt	Q16533	Q8K0S9
RefSeq (мРНК)	NM_003082	NM_178392
RefSeq (білок)	NP_003073	NP_848479
Локус (UCSC)	Хр. 14: 61.76 – 61.8 Mb	Хр. 12: 74.01 – 74.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNAPC1 (англ. Small nuclear RNA activating complex polypeptide 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 368 амінокислот, а молекулярна маса — 42 994.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGTPPGLQTD		CEALLSRFQE		TDSVRFEDFT		ELWRNMKFGT		IFCGRMRNLE
KNMFTKEALA		LAWRYFLPPY		TFQIRVGALY		LLYGLYNTQL		CQPKQKIRVA
LKDWDEVLKF		QQDLVNAQHF		DAAYIFRKLR		LDRAFHFTAM		PKLLSYRMKK
KIHRAEVTEE		FKDPSDRVMK		LITSDVLEEM		LNVHDHYQNM		KHVISVDKSK
PDKALSLIKD		DFFDNIKNIV		LEHQQWHKDR		KNPSLKSKTN		DGEEKMEGNS
QETERCERAE		SLAKIKSKAF		SVVIQASKSR		RHRQVKLDSS		DSDSASGQGQ
VKATRKKEKK		ERLKPAGRKM		SLRNKGNVQN		IHKEDKPLSL		SMPVITEEEE
NESLSGTEFT		ASKKRRKH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Henry R.W., Sadowski C.L., Kobayashi R., Hernandez N. (1995). A TBP-TAF complex required for transcription of human snRNA genes by RNA polymerase II and III. Nature. 374: 653—656. PMID 7715707 DOI:10.1038/374653a0
• Yoon J.B., Roeder R.G. (1996). Cloning of two proximal sequence element-binding transcription factor subunits (gamma and delta) that are required for transcription of small nuclear RNA genes by RNA polymerases II and III and interact with the TATA-binding protein. Mol. Cell. Biol. 16: 1—9. PMID 8524284 DOI:10.1128/MCB.16.1.1
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ma B., Hernandez N. (2001). A map of protein-protein contacts within the small nuclear RNA-activating protein complex SNAPc. J. Biol. Chem. 276: 5027—5035. PMID 11056176 DOI:10.1074/jbc.M009301200
• Hinkley C.S., Hirsch H.A., Gu L., LaMere B., Henry R.W. (2003). The small nuclear RNA-activating protein 190 Myb DNA binding domain stimulates TATA box-binding protein-TATA box recognition. J. Biol. Chem. 278: 18649—18657. PMID 12621023 DOI:10.1074/jbc.M204247200

Див. також

• Хромосома 14