SNF8

SNF8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2ZME, 3CUQ
Ідентифікатори
Символи	SNF8, Dot3, EAP30, VPS22, ESCRT-II complex subunit, SNF8 subunit of ESCRT-II
Зовнішні ІД	OMIM: 610904 MGI: 1343161 HomoloGene: 5239 GeneCards: SNF8
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • protein N-terminus binding • transcription factor binding • protein C-terminus binding • channel regulator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • recycling endosome • гіалоплазма • ендосома • мембрана • late endosome membrane • transcription regulator complex • клітинна мембрана • нуклеоплазма • perinuclear region of cytoplasm • endosome membrane • екзосома • клітинне ядро • ESCRT II complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1903364 positive regulation of protein catabolic process • multivesicular body sorting pathway • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • multivesicular body assembly • regulation of multivesicular body size involved in endosome transport • transcription, DNA-templated • endosomal transport • regulation of protein complex stability • GO:1901313 positive regulation of gene expression • early endosome to late endosome transport • endocytic recycling • GO:1903362 regulation of protein catabolic process • protein transport • regulation of MAP kinase activity • positive regulation of exosomal secretion • protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway • macroautophagy • regulation of molecular function • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11267	27681
Ensembl	ENSG00000159210	ENSMUSG00000006058
UniProt	Q96H20	Q9CZ28
RefSeq (мРНК)	NM_007241 NM_001317192 NM_001317193 NM_001317194	NM_033568 NM_001356362
RefSeq (білок)	NP_001304121 NP_001304122 NP_001304123 NP_009172	NP_291046 NP_001343291
Локус (UCSC)	Хр. 17: 48.93 – 48.94 Mb	Хр. 11: 95.93 – 95.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNF8 (англ. SNF8, ESCRT-II complex subunit) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 258 амінокислот, а молекулярна маса — 28 864.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHRRGVGAGA		IAKKKLAEAK		YKERGTVLAE		DQLAQMSKQL		DMFKTNLEEF
ASKHKQEIRK		NPEFRVQFQD		MCATIGVDPL		ASGKGFWSEM		LGVGDFYYEL
GVQIIEVCLA		LKHRNGGLIT		LEELHQQVLK		GRGKFAQDVS		QDDLIRAIKK
LKALGTGFGI		IPVGGTYLIQ		SVPAELNMDH		TVVLQLAEKN		GYVTVSEIKA
SLKWETERAR		QVLEHLLKEG		LAWLDLQAPG		EAHYWLPALF		TDLYSQEITA
EEAREALP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендосомах.

Література

• Schmidt A.E., Miller T., Schmidt S.L., Shiekhattar R., Shilatifard A. (1999). Cloning and characterization of the EAP30 subunit of the ELL complex that confers derepression of transcription by RNA polymerase II. J. Biol. Chem. 274: 21981—21985. PMID 10419521 DOI:10.1074/jbc.274.31.21981
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
• Progida C., Spinosa M.R., De Luca A., Bucci C. (2006). RILP interacts with the VPS22 component of the ESCRT-II complex. Biochem. Biophys. Res. Commun. 347: 1074—1079. PMID 16857164 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.07.007
• Wang T., Hong W. (2006). RILP interacts with VPS22 and VPS36 of ESCRT-II and regulates their membrane recruitment. Biochem. Biophys. Res. Commun. 350: 413—423. PMID 17010938 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.09.064
• Satoh J., Nanri Y., Yamamura T. (2006). Rapid identification of 14-3-3-binding proteins by protein microarray analysis. J. Neurosci. Methods. 152: 278—288. PMID 16260042 DOI:10.1016/j.jneumeth.2005.09.015

Див. також

• Хромосома 17