SNRPB

SNRPB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1D3B, 3CW1, 3PGW, 4PJO, 4WZJ, 3JCR
Ідентифікатори
Символи	SNRPB, COD, SNRPB1, Sm-B/B', SmB/B', SmB/SmB', snRNP-B, CCMS, small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1
Зовнішні ІД	OMIM: 182282 MGI: 98342 HomoloGene: 134543 GeneCards: SNRPB
Пов'язані генетичні захворювання
cerebro-costo-mandibular syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • histone pre-mRNA DCP binding • U2 snRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • telomerase RNA binding • RNA binding • U1 snRNP binding • U2 snRNP binding Клітинна компонента • цитоплазма • SMN-Sm protein complex • гіалоплазма • catalytic step 2 spliceosome • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • histone pre-mRNA 3'end processing complex • U5 snRNP • U12-type spliceosomal complex • U2 snRNP • U1 snRNP • methylosome • U7 snRNP • small nuclear ribonucleoprotein complex • telomerase holoenzyme complex • spliceosomal complex • U4 snRNP • екзосома • U2-type prespliceosome • клітинне ядро • нуклеоплазма • U2-type precatalytic spliceosome • U2-type catalytic step 2 spliceosome Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • spliceosomal snRNP assembly • Сплайсинг РНК • histone mRNA metabolic process • Метилювання білків • import into nucleus • brain development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6628	20638
Ensembl	ENSG00000125835	ENSMUSG00000027404
UniProt	P14678	P27048
RefSeq (мРНК)	NM_198216 NM_003091	NM_009225
RefSeq (білок)	NP_003082 NP_937859	NP_033251
Локус (UCSC)	Хр. 20: 2.46 – 2.47 Mb	Хр. 2: 130.01 – 130.02 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNRPB (англ. Small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 240 амінокислот, а молекулярна маса — 24 610.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTVGKSSKML		QHIDYRMRCI		LQDGRIFIGT		FKAFDKHMNL		ILCDCDEFRK
IKPKNSKQAE		REEKRVLGLV		LLRGENLVSM		TVEGPPPKDT		GIARVPLAGA
AGGPGIGRAA		GRGIPAGVPM		PQAPAGLAGP		VRGVGGPSQQ		VMTPQGRGTV
AAAAAAATAS		IAGAPTQYPP		GRGGPPPPMG		RGAPPPGMMG		PPPGMRPPMG
PPMGIPPGRG		TPMGMPPPGM		RPPPPGMRGP		PPPGMRPPRP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Schmauss C., McAllister G., Ohosone Y., Hardin J.A., Lerner M.R. (1989). A comparison of snRNP-associated Sm-autoantigens: human N, rat N and human B/B'. Nucleic Acids Res. 17: 1733—1743. PMID 2522186 DOI:10.1093/nar/17.4.1733
• Chu J.-L., Elkon K.B. (1991). The small nuclear ribonucleoproteins, SmB and B', are products of a single gene. Gene. 97: 311—312. PMID 1825643 DOI:10.1016/0378-1119(91)90069-N
• Pillai R.S., Will C.L., Luehrmann R., Schuemperli D., Mueller B. (2001). Purified U7 snRNPs lack the Sm proteins D1 and D2 but contain Lsm10, a new 14 kDa Sm D1-like protein. EMBO J. 20: 5470—5479. PMID 11574479 DOI:10.1093/emboj/20.19.5470
• Narayanan U., Ospina J.K., Frey M.R., Hebert M.D., Matera A.G. (2002). SMN, the spinal muscular atrophy protein, forms a pre-import snRNP complex with snurportin1 and importin beta. Hum. Mol. Genet. 11: 1785—1795. PMID 12095920 DOI:10.1093/hmg/11.15.1785
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Cote J., Richard S. (2005). Tudor domains bind symmetrical dimethylated arginines. J. Biol. Chem. 280: 28476—28483. PMID 15955813 DOI:10.1074/jbc.M414328200

Див. також

• Хромосома 20