SP140

SP140
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2MD7, 2MD8
Ідентифікатори
Символи	SP140, LYSP100, LYSP100-A, LYSP100-B, SP140 nuclear body protein
Зовнішні ІД	OMIM: 608602 MGI: 3702467 HomoloGene: 128391 GeneCards: SP140
Пов'язані генетичні захворювання
Хвороба Крона, розсіяний склероз
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • цитоплазма • PML body • nuclear envelope • мітохондрія • клітинне ядро • нуклеоплазма • fibrillar center • ядерні тільця Біологічний процес • defense response • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11262	434484
Ensembl	ENSG00000079263	ENSMUSG00000070031
UniProt	Q13342	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001005176 NM_001278451 NM_001278452 NM_001278453 NM_007237	NM_001013817
RefSeq (білок)	NP_001005176 NP_001265380 NP_001265381 NP_001265382 NP_009168	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 2: 230.2 – 230.31 Mb	Хр. 1: 85.6 – 85.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SP140 (англ. SP140 nuclear body protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 867 амінокислот, а молекулярна маса — 98 223.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQQGQQGQM		ASGDSNLNFR		MVAEIQNVEG		QNLQEQVCPE		PIFRFFRENK
VEIASAITRP		FPFLMGLRDR		SFISEQMYEH		FQEAFRNLVP		VTRVMYCVLS
ELEKTFGWSH		LEALFSRINL		MAYPDLNEIY		RSFQNVCYEH		SPLQMNNVND
LEDRPRLLPY		GKQENSNACH		EMDDIAVPQE		ALSSSPRCEP		GFSSESCEQL
ALPKAGGGDA		EDAPSLLPGG		GVSCKLAIQI		DEGESEEMPK		LLPYDTEVLE
SNGMIDAART		YSTAPGEKQG		EEEGRNSPRK		RNQDKEKYQE		SPEGRDKETF
DLKTPQVTNE		GEPEKGLCLL		PGEGEEGSDD		CSEMCDGEEP		QEASSSLARC
GSVSCLSAET		FDLKTPQVTN		EGEPEKELSL		LPGEGEEGSD		DCSEMCDGEE
RQEASSSLAR		RGSVSSELEN		HPMNEEGESE		ELASSLLYDN		VPGAEQSAYE
NEKCSCVMCF		SEEVPGSPEA		RTESDQACGT		MDTVDIANNS		TLGKPKRKRR
KKRGHGWSRM		RMRRQENSQQ		NDNSKADGQV		VSSEKKANVN		LKDLSKIRGR
KRGKPGTRFT		QSDRAAQKRV		RSRASRKHKD		ETVDFKAPLL		PVTCGGVKGI
LHKKKLQQGI		LVKCIQTEDG		KWFTPTEFEI		KGGHARSKNW		RLSVRCGGWP
LRWLMENGFL		PDPPRIRYRK		KKRILKSQNN		SSVDPCMRNL		DECEVCRDGG
ELFCCDTCSR		VFHEDCHIPP		VEAERTPWNC		IFCRMKESPG		SQQCCQESEV
LERQMCPEEQ		LKCEFLLLKV		YCCSESSFFA		KIPYYYYIRE		ACQGLKEPMW
LDKIKKRLNE		HGYPQVEGFV		QDMRLIFQNH		RASYKYKDFG		QMGFRLEAEF
EKNFKEVFAI		QETNGNN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Bloch D.B., de la Monte S.M., Guigaouri P., Filippov A., Bloch K.D. (1996). Identification and characterization of a leukocyte-specific component of the nuclear body. J. Biol. Chem. 271: 29198—29204. PMID 8910577 DOI:10.1074/jbc.271.46.29198
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2