SRGAP2

SRGAP2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4RTT, 4RUG, 2DL8
Ідентифікатори
Символи	SRGAP2, ARHGAP34, FNBP2, SRGAP2A, SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 606524 MGI: 109605 HomoloGene: 52683 GeneCards: SRGAP2
Онтологія гена Молекулярна функція • protein homodimerization activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • postsynaptic membrane • cell projection • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • dendritic spine • синапс • міжклітинні контакти • dendritic spine head • phagocytic vesicle • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • клітинне ядро • lamellipodium • клітинна мембрана • нуклеоплазма Біологічний процес • lamellipodium assembly involved in ameboidal cell migration • negative regulation of neuron migration • neuron projection morphogenesis • actin filament severing • filopodium assembly • negative regulation of cell death • нейробіологія розвитку • dendritic spine development • substrate adhesion-dependent cell spreading • extension of a leading process involved in cell motility in cerebral cortex radial glia guided migration • проліферація • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • negative regulation of cell migration Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23380	14270
Ensembl	ENSG00000266028	ENSMUSG00000026425
UniProt	O75044	Q91Z67
RefSeq (мРНК)	NM_001042758 NM_001170637 NM_001300952 NM_015326 NM_001377444 NM_001377445 NM_001377446 NM_001377447	NM_001081011 NM_019520
RefSeq (білок)	NP_001164108 NP_001287881 NP_056141 NP_001364373 NP_001364374 NP_001364375 NP_001364376	NP_001074480
Локус (UCSC)	Хр. 1: 206.2 – 206.46 Mb	Хр. 1: 131.21 – 131.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRGAP2 (англ. SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 071 амінокислот, а молекулярна маса — 120 881.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSPAKFKKD		KEIIAEYDTQ		VKEIRAQLTE		QMKCLDQQCE		LRVQLLQDLQ
DFFRKKAEIE		MDYSRNLEKL		AERFLAKTRS		TKDQQFKKDQ		NVLSPVNCWN
LLLNQVKRES		RDHTTLSDIY		LNNIIPRFVQ		VSEDSGRLFK		KSKEVGQQLQ
DDLMKVLNEL		YSVMKTYHMY		NADSISAQSK		LKEAEKQEEK		QIGKSVKQED
RQTPRSPDST		ANVRIEEKHV		RRSSVKKIEK		MKEKRQAKYT		ENKLKAIKAR
NEYLLALEAT		NASVFKYYIH		DLSDLIDQCC		DLGYHASLNR		ALRTFLSAEL
NLEQSKHEGL		DAIENAVENL		DATSDKQRLM		EMYNNVFCPP		MKFEFQPHMG
DMASQLCAQQ		PVQSELVQRC		QQLQSRLSTL		KIENEEVKKT		MEATLQTIQD
IVTVEDFDVS		DCFQYSNSME		SVKSTVSETF		MSKPSIAKRR		ANQQETEQFY
FTKMKEYLEG		RNLITKLQAK		HDLLQKTLGE		SQRTDCSLAR		RSSTVRKQDS
SQAIPLVVES		CIRFISRHGL		QHEGIFRVSG		SQVEVNDIKN		AFERGEDPLA
GDQNDHDMDS		IAGVLKLYFR		GLEHPLFPKD		IFHDLMACVT		MDNLQERALH
IRKVLLVLPK		TTLIIMRYLF		AFLNHLSQFS		EENMMDPYNL		AICFGPSLMS
VPEGHDQVSC		QAHVNELIKT		IIIQHENIFP		SPRELEGPVY		SRGGSMEDYC
DSPHGETTPV		EDSTQDVTAE		HHTSDDECEP		IEAIAKFDYV		GRTARELSFK
KGASLLLYQR		ASDDWWEGRH		NGIDGLIPHQ		YIVVQDTEDG		VVERSSPKSE
IEVISEPPEE		KVTARAGASC		PSGGHVADIY		LANINKQRKR		PESGSIRKTF
RSDSHGLSSS		LTDSSSPGVG		ASCRPSSQPI		MSQSLPKEGP		DKCSISGHGS
LNSISRHSSL		KNRLDSPQIR		KTATAGRSKS		FNNHRPMDPE		VIAQDIEATM
NSALNELREL		ERQSSVKHTP		DVVLDTLEPL		KTSPVVAPTS		EPSSPLHTQL
LKDPEPAFQR		SASTAGDIAC		AFRPVKSVKM		AAPVKPPATR		PKPTVFPKTN
ATSPGVNSST		SPQSTDKSCT		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як нейрогенез, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

• Voss M., Lettau M., Janssen O. (2009). Identification of SH3 domain interaction partners of human FasL (CD178) by phage display screening. BMC Immunol. 10: 53—53. PMID 19807924 DOI:10.1186/1471-2172-10-53
• Guo S., Bao S. (2010). srGAP2 arginine methylation regulates cell migration and cell spreading through promoting dimerization. J. Biol. Chem. 285: 35133—35141. PMID 20810653 DOI:10.1074/jbc.M110.153429
• Mason F.M., Heimsath E.G., Higgs H.N., Soderling S.H. (2011). Bi-modal regulation of a formin by srGAP2. J. Biol. Chem. 286: 6577—6586. PMID 21148482 DOI:10.1074/jbc.M110.190397
• Coutinho-Budd J., Ghukasyan V., Zylka M.J., Polleux F. (2012). The F-BAR domains from srGAP1, srGAP2, and srGAP3 differentially regulate membrane deformation. J. Cell Sci. 125: 3390—3401. PMID 22467852 DOI:10.1242/jcs.098962

Див. також

• Хромосома 1