SRRT

SRRT
Ідентифікатори
Символи	SRRT, ARS2, ASR2, serrate, serrate, RNA effector molecule
Зовнішні ІД	OMIM: 614469 MGI: 1933527 HomoloGene: 9298 GeneCards: SRRT
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • positive regulation of neurogenesis • Сайленсинг генів • проліферація • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • response to arsenic-containing substance • transcription, DNA-templated • neuronal stem cell population maintenance • GO:1990744, GO:1990729 primary miRNA processing • mRNA splicing, via spliceosome • snRNA transcription by RNA polymerase II • mRNA processing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51593	83701
Ensembl	ENSG00000087087	ENSMUSG00000037364
UniProt	Q9BXP5	Q99MR6
RefSeq (мРНК)	NM_001128852 NM_001128853 NM_001128854 NM_015908 NM_182800	NM_001109909 NM_001109910 NM_031405 NM_001359602
RefSeq (білок)	NP_001122324 NP_001122325 NP_001122326 NP_056992	NP_001103379 NP_001103380 NP_113582 NP_001346531
Локус (UCSC)	Хр. 7: 100.88 – 100.89 Mb	Хр. 5: 137.29 – 137.31 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRRT (англ. Serrate, RNA effector molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 876 амінокислот, а молекулярна маса — 100 666.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGDSDDEYDR		RRRDKFRRER		SDYDRSRERD		ERRRGDDWND		REWDRGRERR
SRGEYRDYDR		NRRERFSPPR		HELSPPQKRM		RRDWDEHSSD		PYHSGYEMPY
AGGGGGPTYG		PPQPWGHPDV		HIMQHHVLPI		QARLGSIAEI		DLGVPPPVMK
TFKEFLLSLD		DSVDETEAVK		RYNDYKLDFR		RQQMQDFFLA		HKDEEWFRSK
YHPDEVGKRR		QEARGALQNR		LRVFLSLMET		GWFDNLLLDI		DKADAIVKML
DAAVIKMEGG		TENDLRILEQ		EEEEEQAGKP		GEPSKKEEGR		AGAGLGDGER
KTNDKDEKKE		DGKQAENDSS		NDDKTKKSEG		DGDKEEKKED		SEKEAKKSSK
KRNRKHSGDD		SFDEGSVSES		ESESESGQAE		EEKEEAEEAL		KEKEKPKEEE
WEKPKDAAGL		ECKPRPLHKT		CSLFMRNIAP		NISRAEIISL		CKRYPGFMRV
ALSEPQPERR		FFRRGWVTFD		RSVNIKEICW		NLQNIRLREC		ELSPGVNRDL
TRRVRNINGI		TQHKQIVRND		IKLAAKLIHT		LDDRTQLWAS		EPGTPPLPTS
LPSQNPILKN		ITDYLIEEVS		AEEEELLGSS		GGAPPEEPPK		EGNPAEINVE
RDEKLIKVLD		KLLLYLRIVH		SLDYYNTCEY		PNEDEMPNRC		GIIHVRGPMP
PNRISHGEVL		EWQKTFEEKL		TPLLSVRESL		SEEEAQKMGR		KDPEQEVEKF
VTSNTQELGK		DKWLCPLSGK		KFKGPEFVRK		HIFNKHAEKI		EEVKKEVAFF
NNFLTDAKRP		ALPEIKPAQP		PGPAQILPPG		LTPGLPYPHQ		TPQGLMPYGQ
PRPPILGYGA		GAVRPAVPTG		GPPYPHAPYG		AGRGNYDAFR		GQGGYPGKPR
NRMVRGDPRA		IVEYRDLDAP		DDVDFF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Kiriyama M., Kobayashi Y., Saito M., Ishikawa F., Yonehara S. (2009). Interaction of FLASH with arsenite resistance protein 2 is involved in cell cycle progression at S phase. Mol. Cell. Biol. 29: 4729—4741. PMID 19546234 DOI:10.1128/MCB.00289-09
• Gilmore-Hebert M., Ramabhadran R., Stern D.F. (2010). Interactions of ErbB4 and Kap1 connect the growth factor and DNA damage response pathways. Mol. Cancer Res. 8: 1388—1398. PMID 20858735 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-10-0042

Див. також

• Хромосома 7