SRSF5

SRSF5
Ідентифікатори
Символи	SRSF5, HRS, SFRS5, SRP40, serine/arginine-rich splicing factor 5, serine and arginine rich splicing factor 5
Зовнішні ІД	OMIM: 600914 MGI: 98287 HomoloGene: 134432 GeneCards: SRSF5
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • protein kinase B binding • RNA binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • ядерце • клітинне ядро • гіалоплазма • nuclear speck Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA processing • mRNA export from nucleus • regulation of cell cycle • liver regeneration • mRNA splice site selection • cellular response to insulin stimulus • mRNA 3'-end processing • liver development • Сплайсинг РНК • response to insulin • RNA export from nucleus • positive regulation of RNA splicing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA cis splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6430	20384
Ensembl	ENSG00000100650	ENSMUSG00000021134
UniProt	Q13243	O35326
RefSeq (мРНК)	NM_001039465 NM_006925 NM_001320214	NM_001079694 NM_001079695 NM_009159 NM_001347415 NM_001347416
RefSeq (білок)	NP_001034554 NP_001307143 NP_008856	NP_001073162 NP_001073163 NP_001334344 NP_001334345 NP_033185
Локус (UCSC)	Хр. 14: 69.73 – 69.77 Mb	Хр. 12: 80.99 – 81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRSF5 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 272 амінокислот, а молекулярна маса — 31 264.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGCRVFIGR		LNPAAREKDV		ERFFKGYGRI		RDIDLKRGFG		FVEFEDPRDA
DDAVYELDGK		ELCSERVTIE		HARARSRGGR		GRGRYSDRFS		SRRPRNDRRN
APPVRTENRL		IVENLSSRVS		WQDLKDFMRQ		AGEVTFADAH		RPKLNEGVVE
FASYGDLKNA		IEKLSGKEIN		GRKIKLIEGS		KRHSRSRSRS		RSRTRSSSRS
RSRSRSRSRK		SYSRSRSRSR		SRSRSKSRSV		SRSPVPEKSQ		KRGSSSRSKS
PASVDRQRSR		SRSRSRSVDS		GN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Du K., Taub R. (1997). Alternative splicing and structure of the human and mouse SFRS5/HRS/SRp40 genes. Gene. 204: 243—249. PMID 9434190 DOI:10.1016/S0378-1119(97)00552-0
• Zahler A.M., Lane W.S., Stolk J.A., Roth M.B. (1992). SR proteins: a conserved family of pre-mRNA splicing factors. Genes Dev. 6: 837—847. PMID 1577277 DOI:10.1101/gad.6.5.837
• Blencowe B.J., Issner R., Nickerson J.A., Sharp P.A. (1998). A coactivator of pre-mRNA splicing. Genes Dev. 12: 996—1009. PMID 9531537 DOI:10.1101/gad.12.7.996
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Див. також

• Хромосома 14