SRSF8

SRSF8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DNM
Ідентифікатори
Символи	SRSF8, DSM-1, SFRS2B, SRP46, serine/arginine-rich splicing factor 8, serine and arginine rich splicing factor 8
Зовнішні ІД	OMIM: 603269 HomoloGene: 130794 GeneCards: SRSF8
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • гіалоплазма • nuclear speck • цитоплазма Біологічний процес • Сплайсинг РНК • mRNA processing • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA cis splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10929	173915
Ensembl	ENSG00000263465	WBGene00004701
UniProt	Q9BRL6	Q09511
RefSeq (мРНК)	NM_032102	NM_062613 NM_001393068
RefSeq (білок)	NP_115285	NP_495013 NP_495014
Локус (UCSC)	Хр. 11: 95.07 – 95.07 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRSF8 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 282 амінокислот, а молекулярна маса — 32 288.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSCGRPPPDV		DGMITLKVDN		LTYRTSPDSL		RRVFEKYGRV		GDVYIPREPH
TKAPRGFAFV		RFHDRRDAQD		AEAAMDGAEL		DGRELRVQVA		RYGRRDLPRS
RQGEPRGRSR		GGGYGRRSRS		YGRRSRSPRR		RHRSRSRGPS		CSRSRSRSRY
RGSRYSRSPY		SRSPYSRSRY		SRSPYSRSRY		RESRYGGSHY		SSSGYSNSRY
SRYHSSRSHS		KSGSSTSSRS		ASTSKSSSAR		RSKSSSVSRS		RSRSRSSSMT
RSPPRVSKRK		SKSRSRSKRP		PKSPEEEGQM		SS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11